Multidrug-Resistant CTX-M and CMY-2 Producing <i>Escherichia coli</i> Isolated from Healthy Household Dogs from the Great Metropolitan Area, Costa Rica
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Objective: This study aimed to determine the prevalence of fecal carriage of antibiotic-resistant Escherichia coli of healthy household dogs with an emphasis on extended-spectrum β-lactamases (ESBL), AmpC-type β-lactamases and resistance to quinolones. Materials and Methods : Rectal swabs were collected from 74 dogs without any clinical evidence of gastrointestinal disease. Samples were cultured on MacConkey agar plates and MacConkey supplemented with 2 μg/mL cefotaxime or 5 μg/mL ciprofloxacin. Isolates were identified with Vitek 2 Compact and susceptibility testing performed by Kirby Bauer disk diffusion method. Minimal inhibitory concentration (MIC) was done on isolates resistant to cefotaxime, ciprofloxacin, and nalidixic acid. PCR amplification was performed to detect CTX-M and CMY-2. Isolates positive for CTX-M and/or CMY-2 were selected for whole-genome sequencing. Results: Multiresistance was detected in 56% of the isolates. A high percentage of resistance was detected for cefazolin (63%), ampicillin (54%), streptomycin (49%), nalidixic acid (42%) and tetracycline (38%). The MIC 50 and MIC 90 for isolates resistant to cefotaxime (24%) was determined as 16 and >250 μg/mL, respectively; for ciprofloxacin (18%), 125 and 250 μg/mL, respectively. ESBL (CTX-M type) and AmpC (CMY-2 type) were detected in 6 (7.1%) and 14 (19%) of the isolates, respectively. Whole-genome sequence analysis showed high genetic diversity in most of the isolates and a large variety of resistance mechanisms, including mobile genetic elements. Conclusion: The frequency of multidrug-resistant E. coli is worrying, mainly because of the presence of many isolates producing ESBL and AmpC β-lactamases. Based on the “One Health” concept, considering the relationships between animals, humans, and the environment, these data support the notion that companion animals are important reservoirs of multidrug-resistant bacteria.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle