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Enregistrement W3093743094 · doi:10.1002/path.5571

<scp>miRNA</scp> repertoires of cystic fibrosis <i>ex vivo</i> models highlight <scp>miR‐181a</scp> and <scp>miR</scp>‐101 that regulate <scp>WISP1</scp> expression

2020· article· en· W3093743094 sur OpenAlexafffund
A. Pommier, Jessica Varilh, Solenne Bleuse, Karine Delétang, Jennifer Bonini, Anne Bergougnoux, Emmanuelle Brochiero, Mireille Claustres, Magali Taulan‐Cadars

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Pathology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAssociation Vaincre la Mucoviscidose
Mots-clésmicroRNABiologyGene isoformEx vivoCystic fibrosisGene expressionDownregulation and upregulationGeneCell biologyRegulation of gene expressionCancer researchImmunologyIn vivoGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cystic fibrosis (CF), a genetic disorder, is characterized by chronic lung disease. Small non-coding RNAs are key regulators of gene expression and participate in various processes, which are dysregulated in CF; however, they remain poorly studied. Here, we determined the complete microRNAs (miRNAs) expression pattern in three CF ex vivo models. The miRNA profiles of air-liquid interface cultures of airway epithelia (bronchi, nasal cells, and nasal polyps) samples from patients with CF and non-CF controls were obtained by deep sequencing. Compared with non-CF controls, several miRNAs were deregulated in CF samples; for instance, miR-181a-5p and the miR-449 family were upregulated. Moreover, mature miRNAs often showed variations (i.e. isomiRs) relative to their reference sequence, such as miR-101, suggesting that miRNAs consist of heterogeneous repertoires of multiple isoforms with different effects on gene expression. Analysis of miR-181a-5p and miR-101-3p roles indicated that they regulate the expression of WISP1, a key component of cell proliferation/migration programs. We showed that miR-101 and miR-181a-5p participated in aberrant recapitulation of wound healing programs by controlling WISP1 mRNA and protein level. Our miRNA expression data bring new insights into CF physiopathology and define new potential therapeutic targets in CF. © 2020 The Pathological Society of Great Britain and Ireland. Published by John Wiley & Sons, Ltd.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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