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Enregistrement W3093891877 · doi:10.1093/cid/ciaa1479

Association Between Minimum Inhibitory Concentration, Beta-lactamase Genes and Mortality for Patients Treated With Piperacillin/Tazobactam or Meropenem From the MERINO Study

2020· article· en· W3093891877 sur OpenAlexaff
Andrew Henderson, David L. Paterson, Mark D. Chatfield, Paul Anantharajah Tambyah, David Chien Lye, Partha Pratim De, R.T.P. Lin, Ka Lip Chew, Yin Mo, T H Lee, Mesut Yılmaz, Rümeysa Çakmak, Thamer H. Alenazi, Yaseen M. Arabi, Marco Falcone, Matteo Bassetti, Elda Righi, Benjamin A. Rogers, Souha S. Kanj, Hasan Bhally, Jonathan R. Iredell, Marc Mendelson, Tom Boyles, David Looke, Spiros Miyakis, Genevieve Walls, Mwinyi Khamis, Ahmed Zikri, Amy Crowe, Paul R. Ingram, Nick Daneman, Paul Griffin, Eugene Athan, Leah W. Roberts, Scott A. Beatson, Anton Y. Peleg, Kyra Cottrell, Michelle J. Bauer, Elizabeth N. Tan, Khin Chaw, Graeme R. Nimmo, Tiffany Harris‐Brown, Patrick N. A. Harris, Peter O. Newton, H Wren, Maryza Graham, Tony M. Korman, Sameera Aljohani, Bassam Alalwan, Khizra Sultana, Assunta Sartor, Darren Welch, Gunnar Kahlmeter

Notice bibliographique

RevueClinical Infectious Diseases · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensHealth Sciences CentreUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research Council
Mots-clésPiperacillin/tazobactamMeropenemMedicinePiperacillinTazobactamOdds ratioInternal medicineBroth microdilutionMinimum inhibitory concentrationBeta-Lactamase InhibitorsMicrobiologyGastroenterologyAntibioticsBiologyAntibiotic resistanceImipenemGeneticsBacteriaPseudomonas aeruginosa

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: This study aims to assess the association of piperacillin/tazobactam and meropenem minimum inhibitory concentration (MIC) and beta-lactam resistance genes with mortality in the MERINO trial. METHODS: Blood culture isolates from enrolled patients were tested by broth microdilution and whole genome sequencing at a central laboratory. Multivariate logistic regression was performed to account for confounders. Absolute risk increase for 30-day mortality between treatment groups was calculated for the primary analysis (PA) and the microbiologic assessable (MA) populations. RESULTS: In total, 320 isolates from 379 enrolled patients were available with susceptibility to piperacillin/tazobactam 94% and meropenem 100%. The piperacillin/tazobactam nonsusceptible breakpoint (MIC >16 mg/L) best predicted 30-day mortality after accounting for confounders (odds ratio 14.9, 95% confidence interval [CI] 2.8-87.2). The absolute risk increase for 30-day mortality for patients treated with piperacillin/tazobactam compared with meropenem was 9% (95% CI 3%-15%) and 8% (95% CI 2%-15%) for the original PA population and the post hoc MA populations, which reduced to 5% (95% CI -1% to 10%) after excluding strains with piperacillin/tazobactam MIC values >16 mg/L. Isolates coharboring extended spectrum β-lactamase (ESBL) and OXA-1 genes were associated with elevated piperacillin/tazobactam MICs and the highest risk increase in 30-day mortality of 14% (95% CI 2%-28%). CONCLUSIONS: After excluding nonsusceptible strains, the 30-day mortality difference from the MERINO trial was less pronounced for piperacillin/tazobactam. Poor reliability in susceptibility testing performance for piperacillin/tazobactam and the high prevalence of OXA coharboring ESBLs suggests that meropenem remains the preferred choice for definitive treatment of ceftriaxone nonsusceptible Escherichia coli and Klebsiella.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,521

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations158
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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