Detecting community change in Arctic marine ecosystems using the temporal dynamics of environmental DNA
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Large‐scale biomonitoring of Arctic coastal marine communities is essential to track temporal changes in ecosystems. Despite the potential of environmental DNA (eDNA) as an innovative coastal biomonitoring tool, important questions remain pertaining to its temporal and spatial variation and how this may affect the evaluation of ecosystem changes over time in hydrodynamic ecosystems. In this study, we used eDNA metabarcoding of coastal water samples in two Canadian Arctic ports to evaluate the potential of eDNA to detect temporal transition in marine coastal communities. We sequenced eDNA from approximately 20 surface water samples collected each month ( N ≈ 150 samples) covering the transition period between summer and late fall using four different universal primer pairs (two pairs of COI mitochondrial genes and two pairs of 18S rRNA genes). Our results from both primer pairs highlighted a significant transition from the summer to the fall marine community. We also observed a putative link between eDNA peaks of read abundance and timing for different life stages (e.g., spawning and larvae) of several species with the most abundant sequence reads. As such, our results show that temporal variation must be considered in ensuring comprehensive coastal biomonitoring with eDNA. Although much remains to be investigated about the ecology of eDNA, our results contribute to fundamental knowledge on the origin of eDNA and highlight the importance of considering temporal variation in developing guidance for coastal biomonitoring with this approach.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle