The ANTsX ecosystem for quantitative biological and medical imaging
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The Advanced Normalizations Tools ecosystem, known as ANTsX, consists of multiple open-source software libraries which house top-performing algorithms used worldwide by scientific and research communities for processing and analyzing biological and medical imaging data. The base software library, ANTs, is built upon, and contributes to, the NIH-sponsored Insight Toolkit. Founded in 2008 with the highly regarded Symmetric Normalization image registration framework, the ANTs library has since grown to include additional functionality. Recent enhancements include statistical, visualization, and deep learning capabilities through interfacing with both the R statistical project (ANTsR) and Python (ANTsPy). Additionally, the corresponding deep learning extensions ANTsRNet and ANTsPyNet (built on the popular TensorFlow/Keras libraries) contain several popular network architectures and trained models for specific applications. One such comprehensive application is a deep learning analog for generating cortical thickness data from structural T1-weighted brain MRI, both cross-sectionally and longitudinally. These pipelines significantly improve computational efficiency and provide comparable-to-superior accuracy over multiple criteria relative to the existing ANTs workflows and simultaneously illustrate the importance of the comprehensive ANTsX approach as a framework for medical image analysis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».