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Enregistrement W3094078202 · doi:10.1038/s41586-020-2885-5

A pooled testing strategy for identifying SARS-CoV-2 at low prevalence

2020· article· en· W3094078202 sur OpenAlexafffund
Léon Mutesa, Pacifique Ndishimye, Yvan Butera, Jacob Souopgui, Annette Uwineza, Robert Rutayisire, Ella Larissa Ndoricimpaye, Emile Musoni, Nadine Rujeni, Thierry Nyatanyi, Edouard Ntagwabira, Muhammed Semakula, Clarisse Musanabaganwa, Daniel Nyamwasa, Maurice Ndashimye, Eva Ujeneza, Ivan Emile Mwikarago, Claude Mambo Muvunyi, Jean Baptiste Mazarati, Sabin Nsanzimana, Neil Turok, Wilfred Ndifon

Notice bibliographique

RevueNature · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing
Établissements canadiensPerimeter Institute
Organismes subventionnairesDivision of Mathematical SciencesAfrican Institute for Mathematical SciencesGovernment of CanadaAcadémie de recherche et d'enseignement supérieurMinistry of Colleges and UniversitiesRwanda Biomedical CentreGlobal Affairs CanadaUniversity of RwandaCarnegie Corporation of New YorkInternational Development Research CentreInstitut Périmètre de physique théoriqueInnovation, Science and Economic Development Canada
Mots-clésPoolingSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Group testingCoronavirus disease 2019 (COVID-19)StatisticsSerial dilutionMedicineSample size determinationReplicateComputer scienceInfectious disease (medical specialty)MathematicsDiseaseArtificial intelligenceInternal medicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,019
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,042
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,098

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0190,042
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,004
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,109
Tête enseignante GPT0,365
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations238
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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