Microbiome Profiling Reveals a Microbial Dysbiosis During a Natural Outbreak of Tenacibaculosis (Yellow Mouth) in Atlantic Salmon
Notice bibliographique
Résumé
Tenacibaculosis remains a major health issue for a number of important aquaculture species globally. On the west coast of Canada, Yellow mouth (YM) disease is responsible for significant economic loss to the Atlantic salmon industry. While Tenacibaculum maritimum is considered to be the primary agent of clinical YM, the impact of YM on the resident microbial community and their influence on the oral cavity is poorly understood. Using a 16s rRNA amplicon sequencing analysis the present study demonstrates a significant dysbiosis and a reduction in diversity of the microbial community in the YM affected Atlantic salmon. The microbial community of YM affected fish was dominated by two amplicon sequence variants (ASVs) of T. maritimum, although other less abundant ASVs were also found. Interestingly clinically unaffected (healthy) and YM surviving fish also had a high relative abundance of T. maritimum, suggesting that the presence of T. maritimum is not solely responsible for YM. A statistically significant association was observed between the abundance of T. maritimum and increased abundance of Vibrio spp within fish displaying clinical signs of YM. Findings from our study provides further evidence that YM is a complex multifactorial disease, characterised by a profound dysbiosis of the microbial community which is dominated by distinct ASVs of T. maritimum. Opportunistic taxa, including Vibrio spp., may also play a role in clinical disease progression.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».