MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3094237499 · doi:10.1080/15592324.2020.1836454

Developmental phenotypes of <i>Arabidopsis</i> plants expressing phosphovariants of <i>AtMYB75</i>

2020· article· en· W3094237499 sur OpenAlexaff
Anna E. Kreynes, Zhen-Hua Yong, Brian E. Ellis

Notice bibliographique

RevuePlant Signaling & Behavior · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésArabidopsisBiologyEctopic expressionMutantGenePhenotypeCell biologyTranscription factorRepressorArabidopsis thalianaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Arabidopsis transcription factor Myeloblastosis protein 75 (MYB75, AT1G56650) is a well-established transcriptional activator of genes required for anthocyanin and flavonoid production, and a repressor of lignin and other secondary cell wall biosynthesis genes. MYB75 is itself tightly regulated at the transcriptional, translational and post-translational levels, including protein phosphorylation by Arabidopsis MAP kinases Examination of the behavior of different phosphovariant versions of MYB75 in vitro and in vivo revealed that overexpression of the MYB75T131E phosphovariant had a particularly marked effect on global changes in gene expression suggesting that phosphorylated MYB75 could be involved in a broader range of functions than previously recognized. Here, we describe a range of distinct developmental phenotypes observed among Arabidopsis lines expressing various phosphovariant forms of MYB75. Expression of either MYB75T131E or MYB75T131A phosphovariants, from the endogenous MYB75 promoter, in Arabidopsis myb75− mutants (Nossen background), resulted in severely impaired germination rates, and developmental arrest at early seedling stages. Arabidopsis plants overexpressing MYB75T131E from a strong constitutive Cauliflower mosaic virus (CaMV35S) promoter displayed slower development, with delayed bolting, flowering and onset of senescence. Conversely, MYB75T131A -overexpressing lines flowered and set seed earlier than either Col-0 WT controls or other MYB75-overexpressors (MYB75WT and MYB75T131E). Histochemical analysis of mature stems also revealed ectopic vessel development in plants overexpressing MYB75; this phenotype was particularly prominent in the MYB75T131E phosphovariant. These data suggest that MYB75 plays a significant role in plant development, and that this aspect of MYB75 function is influenced by its phosphorylation status.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePlant Signaling & BehaviorMême sujetPlant Gene Expression AnalysisTravaux en français237 207