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Enregistrement W3094366600 · doi:10.1016/j.dcn.2020.100875

Grey and white matter volumes in early childhood: A comparison of voxel-based morphometry pipelines

2020· article· en· W3094366600 sur OpenAlexafffund
Logan Haynes, Amanda Ip, Ivy Y.K. Cho, Dennis Dimond, Christiane S. Rohr, Mercedes Bagshawe, Deborah Dewey, Catherine Lebel, Signe Bray

Notice bibliographique

RevueDevelopmental Cognitive Neuroscience · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced Neuroimaging Techniques and Applications
Établissements canadiensHotchkiss Brain InstituteAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésVoxelVoxel-based morphometryWhite matterGrey matterPsychologyArtificial intelligenceMagnetic resonance imagingComputer scienceMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Early childhood is an important period of sensory, motor, cognitive and socio-emotional maturation, yet relatively little is known about the brain changes specific to this period. Voxel-based morphometry (VBM) is a technique to estimate regional brain volumes from magnetic resonance (MR) images. The default VBM processing pipeline can be customized to increase accuracy of segmentation and normalization, yet the impact of customizations on analyses in young children are not clear. Here, we assessed the impact of different preprocessing steps on T1-weighted MR images from typically developing children in two separate cohorts. Data were processed with the Computational Anatomy Toolbox (CAT12), using seven different VBM pipelines with distinct combinations of tissue probability maps (TPMs) and DARTEL templates created using the Template-O-Matic, and CerebroMatic. The first cohort comprised female children aged 3.9-7.9 years (N = 62) and the second included boys and girls aged 2.7-8 years (N = 74). We found that pipelines differed significantly in their tendency to classify voxels as grey or white matter and the conclusions about some age effects were pipeline-dependent. Our study helps to both understand age-associations in grey and white matter volume across early childhood and elucidate the impact of VBM customization on brain volumes in this age range.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,485

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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