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Enregistrement W3094386711 · doi:10.1038/s41598-020-70847-9

Host genetic variation explains reduced protection of commercial vaccines against Piscirickettsia salmonis in Atlantic salmon

2020· article· en· W3094386711 sur OpenAlexaff
Carolina Figueroa, Pamela Veloso, Lenin Espin, Brian Dixon, Débora Torrealba, Islam Said Elalfy, Juan Manuel Afonso, Carlos Soto, Pablo Conejeros, José Gallardo

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAquaculture disease management and microbiota
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesComisión Nacional de Investigación Científica y TecnológicaPontificia Universidad Católica de ValparaísoUniversidad de ValparaísoBanco Santander
Mots-clésVaccinationBiologyOffspringGenetic variationHost (biology)ZoologyImmune systemVirologyImmunologyGeneEcologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vaccination is a widely used control strategy to prevent Piscirickettsia salmonis causing disease in salmon farming. However, it is not known why all the currently available commercial vaccines generally fail to protect against this pathogenic bacteria. Here, we report, from two different populations, that between-family variation is a strong intrinsic factor that determines vaccine protection for this disease. While in some full-sib families, the protection added by vaccination increased the survival time in 13 days in comparison with their unvaccinated siblings; in other families, there was no added protection by vaccination or even it was slightly negative. Resistance to P. salmonis, measured as days to death, was higher in vaccinated than unvaccinated fish, but only a moderate positive genetic correlation was obtained between these traits. This disputes a previous hypothesis, that stated that both traits were fully controlled by the same genes, and challenges the use of unvaccinated fish as gold standard for evaluating and selecting fish resistant to P. salmonis, particularly if the offspring will be vaccinated. More studies are necessary to evaluate if variation in the host immune response to vaccination could explain the between-family differences in resistance observed in vaccinated fish.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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