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Enregistrement W3094512131 · doi:10.14745/ccdr.v46i10a01

Laboratory response checklist for infectious disease outbreaks—preparedness and response considerations for emerging threats

2020· article· en· W3094512131 sur OpenAlexafffundvenueabout
Tracie EisBrenner, Graham Tipples, Theodore I. Kuschak, Matthew W. Gilmour

Notice bibliographique

RevueCanada Communicable Disease Report · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Outbreaks Research
Établissements canadiensCanadian Public Health AssociationProvincial Laboratory of Public Health
Organismes subventionnairesPublic Health AgencyPublic Health Agency of Canada
Mots-clésPreparednessOutbreakEmergency responseChecklistInfectious disease (medical specialty)Emerging infectious diseaseDisaster responseCrisis responseMedicineVirologyDiseaseMedical emergencyBiologyEmergency managementPolitical sciencePublic relationsPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The purpose of the Laboratory Response Checklist for Infectious Disease Outbreaks (the Checklist) is to provide public health laboratories and laboratory networks operating at multiple jurisdictional levels with a useful, adaptable tool to help rapidly identify important outbreak response considerations, particularly when investigating a previously unknown infectious disease threat. The Checklist was developed by the National Microbiology Laboratory of Canada in collaboration with provincial/territorial, national and international laboratory experts, including the Canadian Public Health Laboratory Network, and the Global Health Security Action Group Laboratory Network. While the Checklist was initially designed to reflect lessons learned through National Microbiology Laboratory participation in extended national and international outbreak responses (e.g. Zika virus epidemic [2015-2016], Ebola virus epidemic, West Africa [2014-2016]), the importance of optimizing laboratory response coordination has only been underscored by the ongoing challenges presented by the coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic response requirements. The Checklist identifies five highly interdependent laboratory response themes, each of which encompasses multiple considerations that may be critical to a coordinated, strategic outbreak response. As such, the comprehensive review of Checklist considerations by responding laboratory organizations may provide a valuable opportunity to quickly detect key response considerations and interdependencies, and mitigate risks with the potential to impact public health action.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,041
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,118
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,959
Score d'incertitude au seuil0,219

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0410,118
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0080,002
Études des sciences et des technologies0,0050,002
Communication savante0,0040,005
Science ouverte0,0060,006
Intégrité de la recherche0,0030,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0130,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2020
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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