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Enregistrement W3094517913 · doi:10.1101/2020.10.21.336693

Identification of Proteinase Activated Receptor (PAR) cleaving enzymes in human osteoarthritis knee joint synovial fluids

2020· preprint· en· W3094517913 sur OpenAlexafffund
Arundhasa Chandrabalan, Andrew Firth, Robert Litchfield, C. Thomas Appleton, Alan Getgood, Rithwik Ramachandran

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood Coagulation and Thrombosis Mechanisms
Établissements canadiensAlberta Bone and Joint Health InstituteFowler Kennedy Sport Medicine ClinicWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésOsteoarthritisEnzymeReceptorSynovial fluidMatrix metalloproteinaseG protein-coupled receptorCartilageInflammationProteolytic enzymesChemistryMedicineBiochemistryImmunologyPathologyAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Objective Osteoarthritis (OA) is the most prevalent joint disorder with incidence increasing worldwide. Mechanistic insights into OA pathophysiology are still evolving and there are currently no disease-modifying OA drugs available. It is well established that an increase in proteolytic enzyme activity is linked to progressive degradation of the cartilage in OA. Proteolytic enzymes can also trigger inflammation through activation of a family of G-protein coupled receptors (GPCRs) called the Proteinase Activated Receptors (PARs). Here we sought to characterize the PAR activating enzyme repertoire in human OA knee joint fluids. Methods Human knee joint synovial fluids derived from twenty-five OA patients and four healthy donors were screened for PAR cleavage activity using novel genetically encoded human PAR biosensor expressing cells. The class or type of enzymes cleaving the PARs was further characterized using enzyme-selective inhibitors and enzyme-specific fluorogenic substrates. Results Activity of PAR1, PAR2 and PAR4 activating enzymes were identified at substantially different levels in OA patients relative to healthy knee joint synovial fluids. Using enzyme class or type selective inhibitors and fluorogenic substrates we found that serine proteinases, including thrombin-like enzymes, trypsin-like enzymes, and matrix metalloproteinases are the major PAR activating enzymes present in the OA knee synovial fluids. Conclusions Multiple enzymes activating PAR1, PAR2 and PAR4 are present in OA joint fluids. PAR signalling can trigger pro-inflammatory responses and targeting PARs has been proposed as a therapeutic approach in OA. Knowledge of the PAR activators present in the human knee joint will guide study of relevant signaling events and enable future development of novel PAR targeted therapies for OA and other inflammatory joint diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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