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Enregistrement W3094519479 · doi:10.1002/edn3.150

Allometric scaling of eDNA production in stream‐dwelling brook trout (<i>Salvelinus fontinalis</i>) inferred from population size structure

2020· article· en· W3094519479 sur OpenAlexafffund
Matthew C. Yates, Taylor M. Wilcox, Kevin S. McKelvey, Michael K. Young, Michael K. Schwartz, Alison M. Derry

Notice bibliographique

RevueEnvironmental DNA · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesU.S. Geological SurveyWildlife Conservation Society
Mots-clésAllometrySalvelinusTroutBiomass (ecology)STREAMSBiologyEcologyAbundance (ecology)ScalingHabitatRelative species abundanceFish <Actinopterygii>FisheryMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Environmental DNA (eDNA) concentration exhibits a positive correlation with organism abundance in nature, but modeling this relationship could be substantially improved by incorporating the biology of eDNA production. A recent model (Molecular Ecology, 10.1111/mec.15543) extended models of physiological allometric scaling to eDNA production, hypothesizing that brook trout eDNA production scales nonlinearly with mass as a power function with scaling coefficients <1 in lakes. To validate this hypothesis, we reanalyzed previously published data (Biological Conservation, 10.1016/j.biocon.2015.12.023) that examined the correlation between eDNA concentration and brook trout abundance in streams. We found that allometrically scaled mass (ASM) (e.g., ∑(individual mass0.36) best described patterns of eDNA concentration across streams (r2 = 0.43). ASM exhibited substantially improved model fit relative to biomass (r2 = 0.31, ∆AIC = 5.19), indicating that eDNA production did not scale linearly with biomass. However, the explanatory power of ASM was comparable to density (r2 = 0.40, ∆AIC = 1.25). Additionally, the optimal scaling coefficient estimated from the data (0.36) was substantially lower than that found in the previous study. Discrepancies between datasets could be attributable to ecological differences between study habitats (streams vs. lakes) or due to the exclusion of juveniles (i.e., individuals <75 mm) that can be abundant in stream environments. Nevertheless, this study adds to the growing body of literature demonstrating that individual eDNA production does not scale linearly with biomass.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,190
Écart entre enseignants0,180 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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