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Enregistrement W3094631648 · doi:10.1136/bmjopen-2020-041733

IMAGINE Network’s Mind And Gut Interactions Cohort (MAGIC) Study: a protocol for a prospective observational multicentre cohort study in inflammatory bowel disease and irritable bowel syndrome

2020· article· en· W3094631648 sur OpenAlexafffundabout
Paul Moayyedi, Glenda MacQueen, Çharles N. Bernstein, Stephen Vanner, Přemysl Berčík, Karen Madsen, Michael G. Surette, John D. Rioux, Levinus A. Dieleman, Elena F. Verdú, Russell J. de Souza, Anthony Otley, Laura E. Targownik, John N. Lavis, Jennifer Cunningham, Deborah A. Marshall, Sandra Zelinsky, Aida Fernandes

Notice bibliographique

RevueBMJ Open · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGastrointestinal motility and disorders
Établissements canadiensMount Sinai HospitalDalhousie UniversityMcMaster UniversityQueen's UniversityUniversity of ManitobaPopulation Health Research InstituteUniversité de MontréalUniversity of AlbertaAlberta InnovatesUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCrohn's and Colitis Canada
Mots-clésMedicineIrritable bowel syndromeObservational studyCohortCohort studyInflammatory bowel diseaseDiseaseProspective cohort studyInternal medicineComorbidity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Gut microbiome and diet may be important in irritable bowel syndrome (IBS), inflammatory bowel disease (IBD) and comorbid psychiatric conditions, but the mechanisms are unclear. We will create a large cohort of patients with IBS, IBD and healthy controls, and follow them over time, collecting dietary and mental health information and biological samples, to assess their gastrointestinal (GI) and psychological symptoms in association with their diet, gut microbiome and metabolome. METHODS AND ANALYSIS: This 5-year observational prospective cohort study is recruiting 8000 participants from 15 Canadian centres. Persons with IBS who are 13 years of age and older or IBD ≥5 years will be recruited. Healthy controls will be recruited from the general public and from friends or relatives of those with IBD or IBS who do not have GI symptoms. Participants answer surveys and provide blood, urine and stool samples annually. Surveys assess disease activity, quality of life, physical pain, lifestyle factors, psychological status and diet. The main outcomes evaluated will be the association between the diet, inflammatory, genetic, microbiome and metabolomic profiles in those with IBD and IBS compared with healthy controls using multivariate logistic regression. We will also compare these profiles in those with active versus quiescent disease and those with and without psychological comorbidity. ETHICS AND DISSEMINATION: NCT03131414.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,017
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,015
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,088

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0170,015
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0040,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0210,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,085
Tête enseignante GPT0,403
Écart entre enseignants0,318 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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