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Enregistrement W3094998124 · doi:10.3389/fgene.2020.591099

Multifaceted Actions of GFI1 and GFI1B in Hematopoietic Stem Cell Self-Renewal and Lineage Commitment

2020· review· en· W3094998124 sur OpenAlexafffund
Hugues Beauchemin, Tarik Möröy

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Genetics · 2020
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBlood disorders and treatments
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversité de MontréalMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyZinc fingerHaematopoiesisProgenitor cellChromatinCell biologyStem cellMyeloidHistoneDNA methylationGeneticsTranscription factorCancer researchGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Growth factor independence 1 (GFI1) and the closely related protein GFI1B are small nuclear proteins that act as DNA binding transcriptional repressors. Both recognize the same consensus DNA binding motif via their C-terminal zinc finger domains and regulate the expression of their target genes by recruiting chromatin modifiers such as histone deacetylases (HDACs) and demethylases (LSD1) through an N-terminal SNAG domain that comprises only 20 amino acids. The only region that is different between both proteins is the region that separates the zinc finger domains and the SNAG domain. Both proteins are co-expressed in hematopoietic stem cells (HSCs) and to some extent in multipotent progenitors (MPPS), but expression is specified as soon as early progenitors show signs of lineage bias. While expression of GFI1 is maintained in LMPPs (lymphoid primed multipotent progenitors) that have the potential to differentiate into both myeloid and lymphoid cells, GFI1B expression is no longer detectable in these cells. By contrast, GFI1 expression is lost in megakaryocyte precursors (MKPs) and in megakaryocytic erythrocyte progenitors (MEPs), which maintain a high level of GFI1B expression. Consequently, GFI1 drives myeloid and lymphoid differentiation and GFI1B the development of megakaryocytes, platelets and erythrocytes. How such complementary cell type- and lineage specific functions of GFI1 and GFI1B are maintained is still an unresolved question in particular since they share an almost identical structure and very similar biochemical functions. The cell type specific accessibility of GFI1/B binding sites may offer an explanation, but also the fact that both proteins can have different, non-transcriptional functions where GFI1 controls the activity of DNA repair proteins and GFI1B regulates the Wnt/beta catenin signaling pathway. In addition, GFI1 and GFI1B are required for endothelial cells to become the first blood cells during early murine development and are among those transcription factors needed to convert adult endothelial cells or fibroblasts into hematopoietic stem cells. This role of GFI1 and GFI1B bears high significance for the ongoing effort to generate hematopoietic stem and -progenitor cells de novo for the autologous treatment of blood disorders such as leukemia and lymphoma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,989
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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