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Enregistrement W3095031408 · doi:10.1038/s41598-020-75652-y

Whole transcriptome analysis of adrenal glands from prenatal glucocorticoid programmed hypertensive rodents

2020· article· en· W3095031408 sur OpenAlexafffund
Sujeenthar Tharmalingam, Sandhya Khurana, Alyssa Murray, Jeremy M. LaMothe, T.C. Tai

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBirth, Development, and Health
Établissements canadiensNOSM UniversityLaurentian UniversityHealth Sciences North
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMitacsBruce Power
Mots-clésPER2PER1EndocrinologyInternal medicineGlucocorticoidTranscriptomeCircadian rhythmOffspringBiologyGene expression profilingMicroarray analysis techniquesMicroarrayGene expressionDownregulation and upregulationCLOCKMedicineCircadian clockGenePregnancyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Prenatal glucocorticoid exposure is associated with the development of hypertension in adults. We have previously demonstrated that antenatal dexamethosone (DEX) administration in Wistar-Kyoto dams results in offspring with increased blood pressure coupled with elevated plasma epinephrine levels. In order to elucidate the molecular mechanisms responsible for prenatal DEX-mediated programming of hypertension, a whole-transcriptome analysis was performed on DEX programmed WKY male adrenal glands using the Rat Gene 2.0 microarray. Differential gene expression (DEG) analysis of DEX-exposed offspring compared with saline-treated controls revealed 142 significant DEGs (109 upregulated and 33 downregulated genes). DEG pathway enrichment analysis demonstrated that genes involved in circadian rhythm signaling were most robustly dysregulated. RT-qPCR analysis confirmed the increased expression of circadian genes Bmal1 and Npas2, while Per2, Per3, Cry2 and Bhlhe41 were significantly downregulated. In contrast, gene expression profiling of Spontaneously Hypertensive (SHR) rats, a genetic model of hypertension, demonstrated decreased expression of Bmal1 and Npas2, while Per1, Per2, Per3, Cry1, Cry2, Bhlhe41 and Csnk1D were all upregulated compared to naïve WKY controls. Taken together, this study establishes that glucocorticoid programmed adrenals have impaired circadian signaling and that changes in adrenal circadian rhythm may be an underlying molecular mechanism responsible for the development of hypertension.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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