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Enregistrement W3095038456 · doi:10.1038/s41436-020-01011-x

New insights into the clinical and molecular spectrum of the novel CYFIP2-related neurodevelopmental disorder and impairment of the WRC-mediated actin dynamics

2020· article· en· W3095038456 sur OpenAlexaff
Anaïs Begemann, Heinrich Sticht, Amber Begtrup, Antonio Vitobello, Laurence Faivre, Siddharth Banka, Bader Alhaddad, Reza Asadollahi, Jessica Becker, Tatjana Bierhals, Kathleen Brown, Ange‐Line Bruel, Theresa Brunet, Maryline Carneiro, Kirsten Cremer, Robert C. Day, Anne‐Sophie Denommé‐Pichon, Dave A. Dyment, Hartmut Engels, Rachel S. Fisher, Elaine Goh, M.J. Hajianpour, Lucia Ribeiro Machado Haertel, Nadine Hauer, Maja Hempel, Theresia Herget, Jessika Johannsen, Cornelia Kraus, Gwenaël Le Guyader, Gaëtan Lesca, Frédéric Tran Mau‐Them, John McDermott, Kirsty McWalter, Pierre Meyer, Katrin Õunap, Bernt Popp, Tiia Reimand, Korbinian M. Riedhammer, Martina Russo, Lynette G. Sadleir, Margarita Sáenz, Manuel Schiff, Elisabeth Schuler, Steffen Syrbe, Amelie T. van der Ven, Alain Verloès, Marjolaine Willems, Christiane Zweier, Katharina Steindl, Markus Zweier, Anita Rauch

Notice bibliographique

RevueGenetics in Medicine · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensTrillium Health CentreChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesUniversität ZürichNational Institute for Health and Care ResearchNational Science FoundationEesti TeadusagentuurWellcome TrustSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen Forschung
Mots-clésSpectrum (functional analysis)ActinMedicineBiologyGeneticsPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PurposeA few de novo missense variants in the cytoplasmic FMRP-interacting protein 2 (CYFIP2) gene have recently been described as a novel cause of severe intellectual disability, seizures, and hypotonia in 18 individuals, with p.Arg87 substitutions in the majority.MethodsWe assembled data from 19 newly identified and all 18 previously published individuals with CYFIP2 variants. By structural modeling and investigation of WAVE-regulatory complex (WRC)-mediated actin polymerization in six patient fibroblast lines we assessed the impact of CYFIP2 variants on the WRC.ResultsSixteen of 19 individuals harbor two previously described and 11 novel (likely) disease-associated missense variants. We report p.Asp724 as second mutational hotspot (4/19 cases). Genotype–phenotype correlation confirms a consistently severe phenotype in p.Arg87 patients but a more variable phenotype in p.Asp724 and other substitutions. Three individuals with milder phenotypes carry putative loss-of-function variants, which remain of unclear pathogenicity. Structural modeling predicted missense variants to disturb interactions within the WRC or impair CYFIP2 stability. Consistent with its role in WRC-mediated actin polymerization we substantiate aberrant regulation of the actin cytoskeleton in patient fibroblasts.ConclusionOur study expands the clinical and molecular spectrum of CYFIP2-related neurodevelopmental disorder and provides evidence for aberrant WRC-mediated actin dynamics as contributing cellular pathomechanism. A few de novo missense variants in the cytoplasmic FMRP-interacting protein 2 (CYFIP2) gene have recently been described as a novel cause of severe intellectual disability, seizures, and hypotonia in 18 individuals, with p.Arg87 substitutions in the majority. We assembled data from 19 newly identified and all 18 previously published individuals with CYFIP2 variants. By structural modeling and investigation of WAVE-regulatory complex (WRC)-mediated actin polymerization in six patient fibroblast lines we assessed the impact of CYFIP2 variants on the WRC. Sixteen of 19 individuals harbor two previously described and 11 novel (likely) disease-associated missense variants. We report p.Asp724 as second mutational hotspot (4/19 cases). Genotype–phenotype correlation confirms a consistently severe phenotype in p.Arg87 patients but a more variable phenotype in p.Asp724 and other substitutions. Three individuals with milder phenotypes carry putative loss-of-function variants, which remain of unclear pathogenicity. Structural modeling predicted missense variants to disturb interactions within the WRC or impair CYFIP2 stability. Consistent with its role in WRC-mediated actin polymerization we substantiate aberrant regulation of the actin cytoskeleton in patient fibroblasts. Our study expands the clinical and molecular spectrum of CYFIP2-related neurodevelopmental disorder and provides evidence for aberrant WRC-mediated actin dynamics as contributing cellular pathomechanism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,478
Score d'incertitude au seuil0,269

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations61
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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