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Enregistrement W3095231735 · doi:10.1101/2020.10.30.362699

Closing the research-implementation gap using data science tools: a case study with pollinators of British Columbia

2020· preprint· en· W3095231735 sur OpenAlexaffabout
Laura Melissa Guzman, Tyler Kelly, Lora A. Morandin, Leithen K. M’Gonigle, Elizabeth Elle

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCitizen scienceComputer scienceGeneral partnershipData scienceConservation scienceSet (abstract data type)Order (exchange)PollinatorWorld Wide WebEcologyPollinationPolitical scienceBusinessBiodiversity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract A challenge in conservation is the gap between knowledge generated by researchers and the information being used to inform conservation practice. This gap, widely known as the research-implementation gap, can limit the effectiveness of conservation practice. One way to address this is to design conservation tools that are easy for practitioners to use. Here, we implement data science methods to develop a tool to aid in conservation of pollinators in British Columbia. Specifically, in collaboration with Pollinator Partnership Canada, we jointly develop an interactive web app, the goal of which is two-fold: (i) to allow end users to easily find and interact with the data collected by researchers on pollinators in British Columbia (prior to development of this app, data were buried in supplements from individual research publications) and (ii) employ up to date statistical tools in order to analyse phenological coverage of a set of plants. Previously, these tools required high programming competency in order to access. Our app provides an example of one way that we can make the products of academic research more accessible to conservation practitioners. We also provide the source code to allow other developers to develop similar apps suitable for their data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,022
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,034
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,253
Score d'incertitude au seuil0,509

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0220,034
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,004
Études des sciences et des technologies0,0190,007
Communication savante0,0070,003
Science ouverte0,0030,005
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,258
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,072 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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