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Enregistrement W3095492156 · doi:10.1038/s41436-020-00988-9

NEXMIF encephalopathy: an X-linked disorder with male and female phenotypic patterns

2020· article· en· W3095492156 sur OpenAlexafffund
Hannah Stamberger, Trine Bjørg Hammer, Elena Gardella, Danique R.M. Vlaskamp, Birgitte Bertelsen, Simone Mandelstam, Iris Lange, Jing Zhang, Candace T. Myers, Christina Fenger, Zaid Afawi, Edith P. Almanza Fuerte, Danielle M. Andrade, Yunus Balcik, Bruria Ben Zeev, Mark F. Bennett, Samuel F. Berkovic, Bertrand Isidor, Arjan Bouman, Eva H. Brilstra, Øyvind L. Busk, Anita Cairns, Roseline Caumes, Nicolas Chatron, Russell C. Dale, Christa de Geus, Patrick Edery, Deepak Gill, Jacob Bie Granild-Jensen, Lauren Gunderson, Boudewijn Gunning, Gali Heimer, Johan Robert Helle, Michael S. Hildebrand, Georgie Hollingsworth, Volodymyr Kharytonov, Eric W. Klee, Bobby P.C. Koeleman, David A. Koolen, Christian Korff, Sébastien Küry, Gaëtan Lesca, Dorit Lev, Richard J. Leventer, Mark T. Mackay, Erica L. Macke, Meriel McEntagart, Shekeeb S. Mohammad, Pauline Monin, Martino Montomoli, Éva Morava, Sébastien Moutton, Alison M. Muir, Elena Parrini, Peter Procopis, Emmanuelle Ranza, Laura Reed, Philipp S. Reif, Felix Rosenow, Massimiliano Rossi, Lynette G. Sadleir, Tara Sadoway, Helenius J. Schelhaas, Amy Schneider, Krati Shah, Ruth S. Shalev, Sanjay M. Sisodiya, Thomas Smol, Connie T. R. M. Stumpel, Kyra E. Stuurman, Joseph D. Symonds, Frédéric Tran Mau‐Them, Nienke E. Verbeek, Judith Verhoeven, Geoff Wallace, Keren Yosovich, Yuri A. Zárate, Ayelet Zerem, Sameer M. Zuberi, Renzo Guerrini, Heather C. Mefford, Chirag Patel, Yue-Hua Zhang, Rikke S. Møller, Ingrid E. Scheffer

Notice bibliographique

RevueGenetics in Medicine · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensToronto Western HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Health and Medical Research CouncilFondazione PisaRegione ToscanaMedical Research CouncilGW ResearchEpilepsy Research Program of the Ontario Brain InstituteVlaamse regeringUltragenyx PharmaceuticalFondazione Pierfranco e Luisa MarianiEisaiUCB PharmaCure KidsNational Institutes of HealthMinistero della SaluteEpilepsy Research UKState Government of VictoriaGlaxoSmithKlineLivaNovaMarinus PharmaceuticalsAustralian GovernmentZynerba PharmaceuticalsGW PharmaceuticalsZogenixMarch of Dimes FoundationHealth Research Council of New ZealandDravet Syndrome UK
Mots-clésPhenotypeEncephalopathyGeneticsMedicineBiologyInternal medicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Pathogenic variants in the X-linked gene NEXMIF (previously KIAA2022) are associated with intellectual disability (ID), autism spectrum disorder, and epilepsy. We aimed to delineate the female and male phenotypic spectrum of NEXMIF encephalopathy. METHODS: Through an international collaboration, we analyzed the phenotypes and genotypes of 87 patients with NEXMIF encephalopathy. RESULTS: Sixty-three females and 24 males (46 new patients) with NEXMIF encephalopathy were studied, with 30 novel variants. Phenotypic features included developmental delay/ID in 86/87 (99%), seizures in 71/86 (83%) and multiple comorbidities. Generalized seizures predominated including myoclonic seizures and absence seizures (both 46/70, 66%), absence with eyelid myoclonia (17/70, 24%), and atonic seizures (30/70, 43%). Males had more severe developmental impairment; females had epilepsy more frequently, and varied from unaffected to severely affected. All NEXMIF pathogenic variants led to a premature stop codon or were deleterious structural variants. Most arose de novo, although X-linked segregation occurred for both sexes. Somatic mosaicism occurred in two males and a family with suspected parental mosaicism. CONCLUSION: NEXMIF encephalopathy is an X-linked, generalized developmental and epileptic encephalopathy characterized by myoclonic-atonic epilepsy overlapping with eyelid myoclonia with absence. Some patients have developmental encephalopathy without epilepsy. Males have more severe developmental impairment. NEXMIF encephalopathy arises due to loss-of-function variants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,361
Score d'incertitude au seuil0,673

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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