Genome-Wide Association Study Identifies Variation in <i>ABO</i> As Risk Factor for Platelet Reactivity in Heparin-Induced Thrombocytopenia
Notice bibliographique
Résumé
Background: Heparin-induced thrombocytopenia (HIT) is an unpredictable, potentially catastrophic adverse effect of heparin treatment resulting from an immune response to platelet factor 4 (PF4)/heparin complexes. Genome-wide association studies (GWAS) have the potential to identify genetic risk factors and generate insights into biological mechanisms of adverse drug reactions. However, published HIT GWAS are underpowered and do not include confirmation of HIT using functional assays. We aimed to identify genetic associations with HIT using a GWAS approach in two European ancestry populations tested for functional assay and PF4/heparin antibody levels. Methods: We performed a GWAS with positive functional assay as the outcome in a large discovery cohort of patients, including heparin-induced platelet aggregation (HIPA) positive cases (n=1243), antibody positive but functional assay negative controls (n=1091), and antibody negative controls (n=1718). Logistic regressions were adjusted for age, gender, and first two principal components. Significant associations from the discovery cohort (alpha=5.00x10-8) were then investigated in a replication cohort of serotonin-release assay (SRA)-confirmed HIT cases (n=173), antibody positive controls (n=125), and antibody negative controls (n=488). All patients were genotyped with the HumanOmniExpressExome BeadChip, including 9,065,510 variants after imputation and quality control. Genes near significantly associated loci were resequenced. Results: In the discovery cohort, a genome-wide significant association was observed between common variation in the ABO gene and HIPA positive status (rs505922 odds ratio 0.738 [0.668-0.816], p=2.813x10-9). This variant was also significantly associated with SRA-confirmed HIT in the replication cohort (odds ratio 0.392 [0.172-0.891], p=0.025). Meta-analysis indicated strong association of ABO variation with positive functional assay (Figure 1). Sequencing and fine-mapping of the ABO locus indicated this effect was driven by ABO blood groups, with the O blood group being a risk factor for HIT (odds ratio 1.42 [1.25-1.61], p=6.11x10-8). Conclusions: We identify common variation in ABO as a risk factor for platelet reactivity and HIT. Strong association of ABO variation may have important implications for prediction and understanding of HIT pathogenesis. Figure 1 Disclosures No relevant conflicts of interest to declare.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
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Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».