MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3095990606 · doi:10.1038/s41598-020-75515-6

Prediction of mortality in severe acute malnutrition in hospitalized children by faecal volatile organic compound analysis: proof of concept

2020· article· en· W3095990606 sur OpenAlexaff
Deborah A. van den Brink, Tim de Meij, Daniëlla Brals, Robert Bandsma, Johnstone Thitiri, Moses M. Ngari, Laura Mwalekwa, Nanne K.H. de Boer, Alfian Wicaksono, James A. Covington, Patrick F. van Rheenen, Wieger Voskuijl

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueAdvanced Chemical Sensor Technologies
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesThrasher Research FundBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésSevere Acute MalnutritionMalnutritionMicrobiomeGut microbiomeMedicineFecesGut floraInternal medicineBiologyBioinformaticsImmunologyMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Children with severe acute malnutrition (SAM) display immature, altered gut microbiota and have a high mortality risk. Faecal volatile organic compounds (VOCs) reflect the microbiota composition and may provide insight into metabolic dysfunction that occurs in SAM. Here we determine whether analysis of faecal VOCs could identify children with SAM with increased risk of mortality. VOC profiles from children who died within six days following admission were compared to those who were discharged alive using machine learning algorithms. VOC profiles of children who died could be separated from those who were discharged with fair accuracy (AUC) = 0.71; 95% CI 0.59-0.87; P = 0.004). We present the first study showing differences in faecal VOC profiles between children with SAM who survived and those who died. VOC analysis holds potential to help discover metabolic pathways within the intestinal microbiome with causal association with mortality and target treatments in children with SAM.Trial Registration: The F75 study is registered at clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT02246296.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,031

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueScientific ReportsMême sujetAdvanced Chemical Sensor TechnologiesTravaux en français237 207