Different amplitudes of temperature fluctuation induce distinct transcriptomic and metabolomic responses in the dung beetle <i>Phanaeus vindex</i>
Notice bibliographique
Résumé
Most studies exploring molecular and physiological responses to temperature have focused on constant temperature treatments. To gain a better understanding of the impacts of fluctuating temperatures, we investigated impacts of increased temperature variation on Phanaeus vindex dung beetles across levels of biological organization. Specifically, we hypothesized that increased temperature variation is energetically demanding. We predicted that thermal sensitivity of metabolic rate and energetic reserves would be reduced with increasing fluctuation. To test this, we examined responses of dung beetles exposed to constant (20°C), low fluctuation (20±5°C), or high fluctuation (20±12°C) temperature treatments using respirometry, energetic reserves, and HPLC-MS-based metabolomics. We found no significant differences in metabolic rates or energetic reserves, suggesting increased fluctuations were not energetically demanding. To understand why there was no effect of increased amplitude on energetics, we assembled and annotated a de novo transcriptome, finding non-overlapping transcriptomic and metabolomic responses of beetles exposed to different fluctuations. We found that 58 metabolites increased in abundance in both fluctuation treatments, but 15 only did so in response to high amplitude fluctuations. We found 120 transcripts were significantly upregulated following acclimation to any fluctuation, but 174 were upregulated only in beetles from the high amplitude fluctuation. Several differentially expressed transcripts were associated with post-translational modifications to histones that support a more open chromatin structure. Our results demonstrate that acclimation to different temperature fluctuations is distinct and may be supported by increasing transcriptional plasticity. Our results indicate for the first time that histone modifications may underlie rapid acclimation to temperature variation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».