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Enregistrement W3096208378 · doi:10.1111/bpa.12918

Intracranial mesenchymal tumor with FET‐CREB fusion—A unifying diagnosis for the spectrum of intracranial myxoid mesenchymal tumors and angiomatoid fibrous histiocytoma‐like neoplasms

2020· article· en· W3096208378 sur OpenAlexaff
Emily A. Sloan, Jason Chiang, Javier Villanueva-Meyer, Sanda Alexandrescu, Jennifer Eschbacher, Wesley Wang, Manuela Mafra, Nasir Ud Din, Emily Carr‐Boyd, Michael E. Watson, Michael Punsoni, Angélica Oviedo, Ahmed Gilani, Bette K. Kleinschmidt‐DeMasters, Dylan Coss, M. Beatriz S. Lopes, Corey Raffel, Mitchel S. Berger, Susan M. Chang, Alyssa Reddy, Biswarathan Ramani, Sean P. Ferris, Julieann C. Lee, Jeffrey W. Hofmann, Soo‐Jin Cho, Andrew Horvai, Melike Pekmezci, Tarık Tihan, Andrew W. Bollen, Fausto J. Rodríguez, David W. Ellison, Arie Perry, David A. Solomon

Notice bibliographique

RevueBrain Pathology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSarcoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNIH Office of the DirectorUniversity of California, San FranciscoNational Institutes of Health
Mots-clésMesenchymal stem cellMedicinePathologyMesenchymal TumorRadiologyImmunohistochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Intracranial mesenchymal tumors with FET-CREB fusions are a recently described group of neoplasms in children and young adults characterized by fusion of a FET family gene (usually EWSR1, but rarely FUS) to a CREB family transcription factor (ATF1, CREB1, or CREM), and have been variously termed intracranial angiomatoid fibrous histiocytoma or intracranial myxoid mesenchymal tumor. The clinical outcomes, histologic features, and genomic landscape are not well defined. Here, we studied 20 patients with intracranial mesenchymal tumors proven to harbor FET-CREB fusion by next-generation sequencing (NGS). The 16 female and four male patients had a median age of 14 years (range 4-70). Tumors were uniformly extra-axial or intraventricular and located at the cerebral convexities (n = 7), falx (2), lateral ventricles (4), tentorium (2), cerebellopontine angle (4), and spinal cord (1). NGS demonstrated that eight tumors harbored EWSR1-ATF1 fusion, seven had EWSR1-CREB1, four had EWSR1-CREM, and one had FUS-CREM. Tumors were uniformly well circumscribed and typically contrast enhancing with solid and cystic growth. Tumors with EWSR1-CREB1 fusions more often featured stellate/spindle cell morphology, mucin-rich stroma, and hemangioma-like vasculature compared to tumors with EWSR1-ATF1 fusions that most often featured sheets of epithelioid cells with mucin-poor collagenous stroma. These tumors demonstrated polyphenotypic immunoprofiles with frequent positivity for desmin, EMA, CD99, MUC4, and synaptophysin, but absence of SSTR2A, myogenin, and HMB45 expression. There was a propensity for local recurrence with a median progression-free survival of 12 months and a median overall survival of greater than 60 months, with three patients succumbing to disease (all with EWSR1-ATF1 fusions). In combination with prior case series, this study provides further insight into intracranial mesenchymal tumors with FET-CREB fusion, which represent a distinct group of CNS tumors encompassing both intracranial myxoid mesenchymal tumor and angiomatoid fibrous histiocytoma-like neoplasms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations91
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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