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Enregistrement W3096254404 · doi:10.1101/2020.11.02.365890

An epithelial <i>Nfkb2</i> pathway exacerbates intestinal inflammation by supplementing latent RelA dimers to the canonical NF-κB module

2020· preprint· en· W3096254404 sur OpenAlexaff
M. L. Chawla, Tapas Mukherjee, Alvina Deka, Budhaditya Chatterjee, Uday Aditya Sarkar, Amit Singh, Saurabh Kedia, Balaji Banoth, Subhra K. Biswas, Vineet Ahuja, Soumen Basak

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNF-κB Signaling Pathways
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesDepartment of Science and Technology, Ministry of Science and Technology, IndiaUniversity of California, San DiegoDepartment of Biotechnology, Ministry of Science and Technology, IndiaBiogen
Mots-clésNF-κBInflammationCell biologySignal transductionNFKB1ImmunologyInflammatory bowel diseaseBiologyTranscription factorCancer researchRELBChemistryMedicineGeneDiseaseGeneticsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Aberrant inflammation associated with human ailments, including inflammatory bowel disease (IBD), is typically fuelled by the inordinate activity of RelA/NF-κB transcription factors. As such, the canonical NF-κB module mediates controlled nuclear activation of RelA dimers from the latent cytoplasmic complexes. What provokes pathological RelA activity in the colitogenic gut remains unclear. The noncanonical NF-κB pathway promotes immune organogenesis involving Nfkb2 gene products. Because NF-κB pathways are intertwined, we asked if noncanonical signaling aggravated inflammatory RelA activity. Our investigation revealed frequent engagement of the noncanonical pathway in human IBD. In a mouse model, an Nfkb2 function exacerbated gut inflammation by amplifying the epithelial RelA activity induced upon intestinal injury. Our mechanistic studies clarified that cell-autonomous Nfkb2 signaling supplemented latent NF-κB dimers leading to hyperactive canonical RelA response in the inflamed colon. In sum, regulation of latent NF-κB dimers links noncanonical signaling to RelA-driven inflammatory pathologies and may provide for therapeutic targets. In brief Noncanonical NF-κB signals in intestinal epithelial cells supplement latent RelA dimers that, in turn, aggravated canonical NF-κB response in the colitogenic gut exacerbating intestinal inflammation. Highlights Human IBD involves the frequent engagement of the noncanonical NF-κB pathway. Mice deficient in the noncanonical signal transducer Nfkb2 are resistant to experimental colitis. Noncanonical NF-κB signaling supplements latent RelA NF-κB dimers. Noncanonical NF-κB signaling amplifies canonical NF-κB response to TLR ligands.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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