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Enregistrement W3096288868 · doi:10.3390/cells9112359

The Role of Sumoylation in the Response to Hypoxia: An Overview

2020· review· en· W3096288868 sur OpenAlexaff
Chrysa Filippopoulou, George Simos, Georgia Chachami

Notice bibliographique

RevueCells · 2020
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesHellenic Foundation for Research and Innovation
Mots-clésSUMO proteinHypoxia (environmental)BiologyCell biologyHypoxia-inducible factorsAngiogenesisErythropoiesisCrosstalkUbiquitinCancer researchChemistryBiochemistryMedicineGeneInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sumoylation is the covalent attachment of the small ubiquitin-related modifier (SUMO) to a vast variety of proteins in order to modulate their function. Sumoylation has emerged as an important modification with a regulatory role in the cellular response to different types of stress including osmotic, hypoxic and oxidative stress. Hypoxia can occur under physiological or pathological conditions, such as ischemia and cancer, as a result of an oxygen imbalance caused by low supply and/or increased consumption. The hypoxia inducible factors (HIFs), and the proteins that regulate their fate, are critical molecular mediators of the response to hypoxia and modulate procedures such as glucose and lipid metabolism, angiogenesis, erythropoiesis and, in the case of cancer, tumor progression and metastasis. Here, we provide an overview of the sumoylation-dependent mechanisms that are activated under hypoxia and the way they influence key players of the hypoxic response pathway. As hypoxia is a hallmark of many diseases, understanding the interrelated connections between the SUMO and the hypoxic signaling pathways can open the way for future molecular therapeutic interventions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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