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Enregistrement W3096319392 · doi:10.1002/jcla.23575

Circular RNA profiling facilitates the diagnosis and prognostic monitoring of breast cancer: A pair‐wise meta‐analysis

2020· review· en· W3096319392 sur OpenAlexaboutno aff
Yanqing Ma, Xiaobin Niu, Sha Yan, Yuchun Liu, Ruihua Dong, Yongwei Li

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Laboratory Analysis · 2020
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCircular RNAs in diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBreast cancerHazard ratioCircular RNAInternal medicineOncologyMedicineCancerBiologymicroRNAGeneGeneticsConfidence interval

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: As circular RNAs (circRNAs) have been found to significantly involve in the onset and progression of multiple malignant tumors including breast cancer (BC), this study aims at evaluating the diagnostic and prognostic values of circRNAs in this malady. METHODS: Available databases were thoroughly searched to collect studies on the diagnosis and/or prognosis of BC using circRNA profiling. The updated Quality Assessment of Diagnostic Accuracy Studies 2 (QUADAS-2) tool and the Newcastle Ottawa Scale (NOS) were used to assess the underlying bias of included studies. Clinical characteristics of the studies were merged by the quantitative-weighted integral method to obtain the combined effects. RESULTS: Sixteen studies were included, comprising 2438 BC cases and 271 noncancerous controls. The expression signature covered 24 circRNAs (down-regulated: circ-VRK1, hsa_circ_0068033, hsa_circ_103110, hsa_circ_104689, and hsa_circ_104821; up-regulated: circAGFG1, hsa_circ_0001785, hsa_circ_0108942, hsa_circ_0001785, hsa_circ_006054, hsa_circ_100219, hsa_circ_406697, circEPSTI1, circANKS1B, circGFRA1, circ_0103552, CDR1-AS, has_circ_001569, hsa_circ_001783, circFBXL5, circ_0005230, circAGFG1, circ-UBAP2, and circ_0006528). The sensitivity and specificity of circRNAs in distinguishing BC patients from noncancerous controls were 0.65 and 0.68, and the corresponding area under the curve was 0.66. Survival analysis revealed that patients showing highly expressed oncogenic circRNAs were associated with increased mortality risks of BC in overall survival (univariate analysis: hazard ratio [HR] = 3.30, P = .000; multivariate analysis: HR = 3.07, P = .000), and disease-free survival (HR = 8.26, P = .000). Stratified analysis based on circRNA expression status and control type also showed robust results. CONCLUSIONS: Circular RNA profiling presents prominent diagnostic and prognostic values in BC, and can be rated as a promising tool facilitating its early diagnosis and survival.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,018
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,030
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,095

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0180,030
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0070,027
Bibliométrie0,0040,006
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,106
Tête enseignante GPT0,419
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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