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Enregistrement W3096504632 · doi:10.1093/jac/dkaa443

Prevalence of antimicrobial resistance genes and its association with restricted antimicrobial use in food-producing animals: a systematic review and meta-analysis

2020· review· en· W3096504632 sur OpenAlexafffund
Diego B. Nóbrega, Karen Tang, Niamh Caffrey, Jeroen De Buck, Susan C. Cork, Paul E. Ronksley, Alicia J. Polachek, Heather Ganshorn, Nishan Sharma, John P. Kastelic, James D. Kellner, William A. Ghali, Herman W. Barkema

Notice bibliographique

RevueJournal of Antimicrobial Chemotherapy · 2020
Typereview
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePharmaceutical and Antibiotic Environmental Impacts
Établissements canadiensUniversity of CalgaryUniversity of GuelphUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesAlberta Innovates - Technology FuturesWorld Health Organization
Mots-clésAntimicrobialBiologyAntibiotic resistanceBacteriaMeta-analysisMicrobiologyBiotechnologyAntibioticsMedicineGeneticsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: There is ongoing debate regarding potential associations between restrictions of antimicrobial use and prevalence of antimicrobial resistance (AMR) in bacteria. OBJECTIVES: To summarize the effects of interventions reducing antimicrobial use in food-producing animals on the prevalence of AMR genes (ARGs) in bacteria from animals and humans. METHODS: We published a full systematic review of restrictions of antimicrobials in food-producing animals and their associations with AMR in bacteria. Herein, we focus on studies reporting on the association between restricted antimicrobial use and prevalence of ARGs. We used multilevel mixed-effects models and a semi-quantitative approach based on forest plots to summarize findings from studies. RESULTS: A positive effect of intervention [reduction in prevalence or number of ARGs in group(s) with restricted antimicrobial use] was reported from 29 studies for at least one ARG. We detected significant associations between a ban on avoparcin and diminished presence of the vanA gene in samples from animals and humans, whereas for the mecA gene, studies agreed on a positive effect of intervention in samples only from animals. Comparisons involving mcr-1, blaCTX-M, aadA2, vat(E), sul2, dfrA5, dfrA13, tet(E) and tet(P) indicated a reduced prevalence of genes in intervention groups. Conversely, no effects were detected for β-lactamases other than blaCTX-M and the remaining tet genes. CONCLUSIONS: The available body of scientific evidence supported that restricted use of antimicrobials in food animals was associated with an either lower or equal presence of ARGs in bacteria, with effects dependent on ARG, host species and restricted drug.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,778
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0060,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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