Genetic variation at the species and population levels in the Rocky Mountain ridged mussel (Gonidea angulata) – Supplementary Material
Notice bibliographique
Résumé
Freshwater mussels in western North America are threatened by water diversions, climate change, loss of required host fish, and other factors, and have experienced marked decline in the past several decades. All four of the primary lineages (potentially species) of freshwater mussels in the western U.S. and Canada are widespread and have somewhat generalist host fish requirements. Of these lineages, perhaps the most poorly understood and of greatest conservation concern is Gonidea angulata (Rocky Mountain ridged mussel). Gonidea is a monotypic genus occurring only in the western continental U.S. and southern Canada. Here we describe the patterns of genetic variation across the species range, including several populations in the Okanagan Valley at the northern edge of the range. We detected only ten mitochondrial cytochrome oxidase I haplotypes, three of which are commonly found across major hydrologic basins, and the remainder of which were basin-specific variants. Haplotypes differed by a maximum of 5 of 537 nucleotides. New microsatellite loci were developed for G. angulata as a part of this study. Data from these microsatellite loci indicated that the population in the Chehalis River, Washington, was distinct from other locations, and that the Okanagan lake population was somewhat diverged from the remaining populations in the Columbia River and Klamath Lake. Only low levels of inbreeding were detected, in contrast to previous findings in Margartifera falcata, suggesting that hermaphroditism is not common. The population with the least diversity, according to microsatellite data, was the northern-most known population in Okanagan Lake. We discuss the biogeographic and conservation implications of our findings and provide supplementary material of our research including sequencing data and narrative of microsatellite development.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».