Screening and Bioinformatics Analysis of Proteins Interacting with StMAPKK1 in Potato by Yeast Two-Hybrid System
Notice bibliographique
Résumé
Mitogen-activated protein kinase (MAPK) cascade reaction is one of important and complex signal networks involved in plant growth and development, hormone and stress response. As one of its main members, mitogen-activated protein kinase kinase (MAPKK) is located in the middle of the cascade reaction and plays a key role in signal collection and divergence. There were shown that potato ( Solanum tuberosum L.) StMAPKK1 (PGSC0003DMT400000744) gene responded to drought stress. Therefore, StMAPKK1 gene was firstly selected to screen its interacting protein. In this study, the bait vector pGBKT7-StMAPKK1 was constructed by homologous recombination and used to screen potato cDNA library by yeast ( Saccharomyces cerevisiae ) two-hybrid system. Five StMAPKK1-interacting proteins, hydrolase (hydrolyzing O-glycosyl compound), RING-H2 subgroup RHE protein, cyanate hydratase, ARF GTPase activator, and a C2 domain-containing protein, were obtained through this screening and were identificated by bioinformatics analysis, and the interaction was verified by small-scale hybridization verification. The results provided theoretical basis for further study on the signal pathway and biological function of potato StMAPKK1.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».