MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3096833132 · doi:10.15252/embj.2020105364

Metabolic shift underlies recovery in reversible infantile respiratory chain deficiency

2020· article· en· W3096833132 sur OpenAlexaff
Denisa Hathazi, Helen Griffin, Matthew J. Jennings, Michele Giunta, Christopher A. Powell, Sarah F. Pearce, Benjamin Munro, Wei Wei, Veronika Boczonadi, Joanna Poulton, Angela Pyle, Claudia Calabrese, Aurora Gómez-Durán, Ulrike Schara, Robert D. S. Pitceathly, Michael G. Hanna, Kairit Joost, Ana Cotta, Júlia Filardi Paim, Mônica Machado Navarro, Jennifer Duff, André Mattman, Kristine Chapman, Serenella Servidei, Adela Della Marina, Johanna Uusimaa, Andreas Roos, Vamsi K. Mootha, Michio Hirano, M. Tulinius, Mamta Giri, Eric Hoffmann, Hanns Lochmüller, Salvatore DiMauro, Michal Minczuk, Patrick F. Chinnery, Juliane Müller, Rita Horváth

Notice bibliographique

RevueThe EMBO Journal · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensOttawa HospitalChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of OttawaSt. Paul's Hospital
Organismes subventionnairesH2020 European Research CouncilMedical Research CouncilLily FoundationNational Institute for Health and Care ResearchEvelyn TrustNewton FundWellcome Trust
Mots-clésBiologyPenetranceMitochondrial DNAMutationMitochondrial diseaseGeneticsMitochondrial biogenesisMitochondrionRespiratory chainMitochondrial respiratory chainMitochondrial myopathyGenePhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Reversible infantile respiratory chain deficiency (RIRCD) is a rare mitochondrial myopathy leading to severe metabolic disturbances in infants, which recover spontaneously after 6-months of age. RIRCD is associated with the homoplasmic m.14674T>C mitochondrial DNA mutation; however, only ~ 1/100 carriers develop the disease. We studied 27 affected and 15 unaffected individuals from 19 families and found additional heterozygous mutations in nuclear genes interacting with mt-tRNAGlu including EARS2 and TRMU in the majority of affected individuals, but not in healthy carriers of m.14674T>C, supporting a digenic inheritance. Our transcriptomic and proteomic analysis of patient muscle suggests a stepwise mechanism where first, the integrated stress response associated with increased FGF21 and GDF15 expression enhances the metabolism modulated by serine biosynthesis, one carbon metabolism, TCA lipid oxidation and amino acid availability, while in the second step mTOR activation leads to increased mitochondrial biogenesis. Our data suggest that the spontaneous recovery in infants with digenic mutations may be modulated by the above described changes. Similar mechanisms may explain the variable penetrance and tissue specificity of other mtDNA mutations and highlight the potential role of amino acids in improving mitochondrial disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,797
Score d'incertitude au seuil0,288

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe EMBO JournalMême sujetMitochondrial Function and PathologyTravaux en français237 207