Parentage-based tagging improves escapement estimates for ESA-listed adult Chinook salmon and steelhead in the Snake River basin
Notice bibliographique
Résumé
Parentage-based tagging (PBT) is a nonlethal, genetic tagging method that has been successfully applied in hatchery-supplemented populations to manage hatchery brood stock and monitor hatchery harvest and straying rates. We show that PBT can also improve the accuracy of escapement estimates by significantly reducing the number of hatchery-origin fish falsely classified as natural-origin. Unlike conventional abundance estimates, which use physical marks and tags to distinguish hatchery individuals from their wild counterparts, PBT identifies origin independent of physical form. We applied PBT to populations of Chinook salmon (Oncorhynchus tshawytscha) and steelhead (Oncorhynchus mykiss), which are classified as Threatened under the Endangered Species Act and subject to extensive hatchery supplementation efforts. For spawn years 2014–2018, 16 511 adipose-intact Chinook salmon and 21 953 adipose-intact steelhead were sampled, and PBT identified 19.6% of returning Chinook salmon and 8.3% of steelhead were of hatchery-origin, despite having no physical or mechanical marks. The 90% confidence intervals for escapement estimates of natural-origin Chinook salmon and steelhead made with and without corrections using PBT were nonoverlapping for nine of ten comparisons, indicating that failing to account for unmarked, untagged hatchery-origin fish would result in a significant overestimation of natural abundance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».