Carbapenem-Resistant Enterobacteriaceae Resistant Only to Ertapenem: An Epidemiologically Distinct Cohort, Atlanta, 2016–2018
Notice bibliographique
Résumé
Background: Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE), particularly carbapenemase-producing (CP) CRE, pose a major public health threat. In 2016, the phenotypic definition of CRE expanded to include ertapenem resistance to improve sensitivity for detecting CP-CRE. We compared characteristics of CRE resistant to ertapenem only (CRE-EO) to CRE resistant to ≥1 other carbapenem (CRE-O). Methods: The Georgia Emerging Infections Program performs active, population-based CRE surveillance in metropolitan Atlanta. CRE cases were defined as any Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, K. oxytoca, K. variicola, Enterobacter cloacae complex, or Enterobacter aerogenes resistant to ≥1 carbapenem by the clinical laboratory and isolated from urine or a sterile site between 2016 and 2018. Data were extracted from retrospective chart review and 90-day mortality from Georgia vital statistics for 2016–2017. Polymerase chain reaction (PCR) for carbapenemase genes was performed on a convenience sample of isolates by the CDC or Georgia Public Health Laboratory. We compared characteristics of CRE-EO cases to CRE-O cases using χ2 tests or t tests. Results: Among 927 CRE isolates, 553 (60%) were CRE-EO. CRE-EO were less frequently isolated from blood (5% vs 12%; P < .01) and less commonly K. pneumoniae (21% vs 58%; P < .01) than CRE-O. CRE-EO cases were more often women (65% vs 50%; P < .01), had a lower Charlson comorbidity index (mean ± SD, 2.4±2.3 vs 3.0±2.6; P < .01), and were less commonly at a long-term care facility (24% vs 31%) or hospital (15% vs 21%; P < .01) in the 4 days prior to the CRE culture. CRE-EO were more susceptible to all antibiotics tested at the clinical laboratory (P < .01) except for tigecycline (P = 1.0) (Table 1). Of the 300 (32%) isolates tested for carbapenemase genes, 98 (33%) were positive (7% CRE-EO vs 62% CRE-O; P < .01). Of the CP isolates, we identified blaKPC in 93 cases (95%), blaNDM in 3 cases (3%), blaOXA-48-like in 2 cases (2%). CRE-EO cases had lower 90-day mortality (13% vs 21%; P < .01). Conclusions: CRE-EO are epidemiologically distinct from CRE-O and are less likely to harbor carbapenemase genes. CRE-EO may require less intensive infection prevention interventions and have more therapeutic options. Funding: None Disclosures: None
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».