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Enregistrement W3097104656 · doi:10.1182/bloodadvances.2020002758

Abortive γδTCR rearrangements suggest ILC2s are derived from T-cell precursors

2020· article· en· W3097104656 sur OpenAlex
Samuel B. Shin, Bernard C. Lo, Maryam Ghaedi, R. Wilder Scott, Yicong Li, Melina Messing, Diana Canals Hernaez, Jessica Cait, Taka Murakami, Michael R. Hughes, Kevin B. Leslie, T. Michael Underhill, Fumio Takei, Kelly M. McNagny

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBlood Advances · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueIL-33, ST2, and ILC Pathways
Établissements canadiensBC Cancer AgencyUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMitacsEmory University
Mots-clésT-cell receptorInnate lymphoid cellBiologyEffectorGeneT cellLineage (genetic)ReceptorCell biologyImmune systemGene rearrangementGeneticsImmunologyAcquired immune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Innate lymphoid cells (ILCs) are a recently identified subset of leukocytes that play a central role in pathogen surveillance and resistance, modulation of immune response, and tissue repair. They are remarkably similar to CD4+ T-helper subsets in terms of function and transcription factors required for their development but are distinguished by their lack of antigen-specific receptors. Despite their similarities, the absence of a surface T-cell receptor (TCR) and presence of ILCs and precursors in adult bone marrow has led to speculation that ILCs and T cells develop separately from lineages that branch at the point of precursors within the bone marrow. Considering the common lineage markers and effector cytokine profiles shared between ILCs and T cells, it is surprising that the status of the TCR loci in ILCs was not fully explored at the time of their discovery. Here, we demonstrate that a high proportion of peripheral tissue ILC2s have TCRγ chain gene rearrangements and TCRδ locus deletions. Detailed analyses of these loci show abundant frameshifts and premature stop codons that would encode nonfunctional TCR proteins. Collectively, these data argue that ILC2 can develop from T cells that fail to appropriately rearrange TCR genes, potentially within the thymus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,342
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle