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Enregistrement W3097217647 · doi:10.1139/bcb-2019-0396

Silencing linc00662 inhibits cell proliferation and colony formation of lung cancer cells via regulating the miR-145-5p–PAFAH1B2 axis

2020· article· en· W3097217647 sur OpenAlexvenueno aff
Zheyuan Xu, Jun Peng, Zhi‐Zhou Shi, Xin-long Chen, Hongzhong Cheng, Han Wang, Yang Wang, Guoping Wang, Wen Jiang, Hao Peng

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGene silencingGene knockdownmicroRNABiologyCancer researchLung cancerOncogeneCompeting endogenous RNAA549 cellCell growthAdenocarcinomaCancerRNA interferenceMolecular biologyCell biologyCellLong non-coding RNACell cultureRNACell cycleGeneInternal medicineMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lung cancer is the most common cause of cancer-related death in the world. Long non-coding RNAs (lncRNAs) are longer than 200 nucleotide transcripts, and are not translated into protein. The lncRNA linc00662 is overexpressed in lung cancer; however, its role in lung cancer is still unknown. In our study, by analyzing the TCGA data, we found that linc00662 was overexpressed in lung adenocarcinoma (LUAD) and lung squamous cell carcinoma (LUSC). We knocked-down the expression of linc00662 using siRNA, and found that silencing linc00662 significantly inhibited the proliferation and colony formation of the lung cancer cell lines A549 and H460. We also found that knockdown of linc00662 increased the expression of the microRNA miR-145-5p and decreased the expression of the platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta (PAFAH1B2) gene. We further show that linc00662 binds with miR-145-5p, and that miR-145-5p binds to the 3′UTR of PAFAH1B2. miR-145-5p negatively regulates PAFAH1B2 both at the mRNA and the protein level. Loss of miR-145-5p abolished the inhibitory effects of silencing linc00662 on the proliferation and colony formation of A549 and H460 cells. These findings indicate that linc00662 functions as an oncogene by acting as a competing endogenous RNA (ceRNA) and sponges and regulates miR-145-5p in lung cancer, and thus may provide a potential target for treating lung cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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