MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3097248357 · doi:10.1186/s12870-020-02724-6

Loss function of SL (sekiguchi lesion) in the rice cultivar Minghui 86 leads to enhanced resistance to (hemi)biotrophic pathogens

2020· article· en· W3097248357 sur OpenAlexfundno aff
Dagang Tian, Fang Yang, Yuqing Niu, Yan Lin, Zaijie Chen, Gang Li, Qiong Luo, Feng Wang, Mo Wang

Notice bibliographique

RevueBMC Plant Biology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of SciencesFujian Academy of Agricultural SciencesMinjiang UniversityChinese Academy of SciencesNatural Science Foundation of Fujian ProvinceChina Postdoctoral Science FoundationFujian Agriculture and Forestry UniversityInstitute of GeneticsNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyJasmonic acidXanthomonas oryzaeTryptamineMutantOryza sativaXanthomonas oryzae pv. oryzaeMicrobiologyMagnaportheSalicylic acidMagnaporthe griseaBiochemistryBotanyPathogenGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Serotonin, originally identified as a neurotransmitter in mammals, functions as an antioxidant to scavenge cellular ROS in plants. In rice, the conversion of tryptamine to serotonin is catalyzed by SL (sekiguchi lesion), a member of cytochrome P450 monooxygenase family. The sl mutant, originated from rice cultivar Sekiguchi-asahi, exhibits spontaneous lesions, whereas its immune responses to pathogens have not been clearly characterized. Results Here we identified three allelic mutants of SL in an indica rice restore line Minghui 86 (MH86), named as sl-MH-1, − 2 and − 3, all of which present the typical lesions under normal growth condition. Compared with those in MH86, the serotonin content in sl-MH-1 is dramatically decreased, whereas the levels of tryptamine and L-trytophan are significantly increased. The sl-MH-1 mutant accumulates high H2O2 level at its lesion sites and is more sensitive to exogenous H2O2 treatment than the wild type. When treated with the reductant vitamin C (Vc), the lesion formation on sl-MH-1 leaves could be efficiently suppressed. In addition, sl-MH-1 displayed more resistant to both the blast fungus and blight bacteria, Pyricularia oryzae (P. oryzae, teleomorph: Magnaporthe oryzae) and Xanthomonas oryzae pv. Oryzae (Xoo), respectively. The pathogen-associated molecular patterns (PAMPs)-triggered immunity (PTI) responses, like reactive oxygen species (ROS) burst and callose deposition, were enhanced in sl-MH-1. Moreover, loss function of SL resulted in higher resting levels of the defense hormones, salicylic acid and jasmonic acid. The RNA-seq analysis indicated that after P. oryzae infection, transcription of the genes involved in reduction-oxidation regulation was the most markedly changed in sl-MH-1, compared with MH86. Conclusions Our results indicate that SL, involving in the final step of serotonin biosynthesis, negatively regulates rice resistance against (hemi)biotrophic pathogens via compromising the PTI responses and defense hormones accumulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBMC Plant BiologyMême sujetPlant-Microbe Interactions and ImmunityTravaux en français237 207