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Enregistrement W3097328617 · doi:10.1017/ice.2020.1126

A Growing Concern: The Emergence and Dissemination of Carbapenemase-producing Enterobacterales (CPE) in Canada

2020· article· en· W3097328617 sur OpenAlexafffundabout
Robyn Mitchell, Laura Mataseje, David A. Boyd, Ghada N. Al‐Rawahi, Ian Davis, Chelsey Ellis, Joanne Embreé, Susy Hota, Pamela Kibsey, pital Maisonneuve-Rosemont, Jerome A. Leis, Allison McGeer, Jessica Minion, Appelle Health Region, Michael R. Mulvey, Sonja Musto, Linda Pelude, Jocelyn A. Srigley, Stephanie Smith, Kathryn N. Suh, Geoffrey Taylor, Nisha Thampi, Titus Wong, Kevin Katz, CNISP PHAC

Notice bibliographique

RevueInfection Control and Hospital Epidemiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensAlberta Hospital EdmontonMoncton HospitalUniversity of ReginaUniversity of AlbertaRegina Qu'Appelle Health RegionVancouver General HospitalRoyal Jubilee HospitalUniversity of Alberta HospitalOttawa HospitalUniversity Health NetworkHealth Sciences CentreUniversity of TorontoBC Children's HospitalChildren's Hospital of Eastern OntarioQueen Elizabeth II Health Sciences CentreHorizon Health NetworkPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesUniversity of AlbertaUniversity of TorontoBC Children's HospitalPublic Health AgencyPublic Health Agency of Canada
Mots-clésMedicineEpidemiologyIncidence (geometry)Health careInfection controlEmergency medicineAcute careEpidemiological surveillanceEnvironmental healthIntensive care medicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Carbapenemase-producing Enterobacterales (CPE) have rapidly become a global health concern and are associated with substantial morbidity and mortality due to limited treatment options. Travel to endemic areas, especially healthcare exposure in these areas, is an important risk factor for acquisition. We describe the evolving epidemiology, molecular features, and outcomes of CPE in Canada through surveillance by the Canadian Nosocomial Infection Surveillance Program (CNISP). Methods: CNISP has conducted surveillance for CPE among inpatients and outpatients of all ages since 2010. Participating acute-care facilities submit eligible specimens to the National Microbiology Laboratory for detection of carbapenemase production, and epidemiological data are collected. Incidence rates per 10,000 patient days are calculated based on inpatient data. Results: In total, 59 CNISP hospitals in 10 Canadian provinces representing 21,789 beds and 6,785,013 patient days participated in this surveillance. From 2010 to 2018, 118 (26%) CPE-infected and 547 (74%) CPE-colonized patients were identified. Few pediatric cases were identified (n = 18). Infection incidence rates remain low and stable (0.02 per 10,000 patient days in 2010 to 0.03 per 10,000 patient days in 2018), and colonization incidence rates have increased by 89% over the surveillance period. Overall, 92% of cases were acquired in a healthcare facility: 61% (n = 278) in a Canadian healthcare facility and 31% (n = 142) in a healthcare facility outside Canada. Of the 8% of cases not acquired in a healthcare facility, 50% (16 of 32) reported travel outside of Canada in the 12 months prior to positive culture. The distribution of carbapenemases varied by region; New Delhi metallo- B -lactamase (NDM) was dominant (59%) in western Canada and Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC) (66%) in central Canada. NDM and class D carbapenemase OXA-48 were more commonly identified among those who traveled outside of Canada, whereas KPC was more commonly identified among patients without travel. In addition, 30-day all-cause mortality was 14% (25 of 181) among CPE infected patients and 32% (14 of 44) among those with bacteremia. Conclusions: CPE rates remain low in Canada; however, national surveillance data suggest that the increase in CPE in Canada is now being driven by local nosocomial transmission as well as travel and healthcare within endemic areas. Changes in screening practices may have contributed to the increase in colonizations; however, these data are currently lacking and will be collected moving forward. These data highlight the need to intensify surveillance and coordinate infection control measures to prevent further spread of CPE in Canadian acute-care hospitals. Funding: None Disclosures: Susy Hota reports contracted research for Finch Therapeutics. Allison McGeer reports funds to her institution for projects for which she is the principal investigator from Pfizer and Merck, as well as consulting fees from the following companies: Sanofi-Pasteur, Sunovion, GSK, Pfizer, and Cidara.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,050
Score d'incertitude au seuil0,870

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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