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Enregistrement W3097432510 · doi:10.1002/csc2.20402

First the seed: Genomic advances in seed science for improved crop productivity and food security

2020· article· en· W3097432510 sur OpenAlexaff
Sangam L. Dwivedi, Charles Spillane, Francesca Lopez, Belay T. Ayele, Rodomiro Ortíz

Notice bibliographique

RevueCrop Science · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSeed Germination and Physiology
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyBiotechnologyGenomicsGermplasmOryza sativaMolecular breedingEndospermSeed dormancyFunctional genomicsGerminationGeneDormancyAgronomyGeneticsGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Seeds are valuable sources of carbohydrates, lipids, proteins, fibers, minerals, and vitamins. They provide energy and nutrition to germinating seedlings, food to humans, feed to livestock, and feedstocks to industry. High‐throughput analyses of gene expression in crops has identified many candidate genes associated with seed dormancy, longevity, germination, and vigor. In this review, we cover the latest research focusing on such key seed traits. Transcriptome analyses of time courses of seed filling have identified sets of genes expressed at different stages of this process. The potential role of epigenetics (including seed–endosperm imprinted genes) in regulating seed development and chemistry is highlighted herein. We also discuss how advances in genomics and seed biology are facilitating the unravelling of associations between seed traits with gene bank accessions and gene sequences, including how functional research can accelerate the discovery of allelic variants. Such knowledge of functional effects relating to gene variants is necessary for more efficient and cost‐effective management of genetic resources or for redesigning crops with specific seed characteristics. For instance, gene bank curators may assess seed viability by monitoring changes in gene expression of biomarker genes in dry seed samples to decide germplasm regeneration and assess genetic integrity of collections by monitoring changes in diversity and allele frequencies between samples of same accession stored in gene banks. We highlight that resistance to preharvest sprouting can be enhanced through genomics‐assisted breeding in otherwise nondormant rice ( Oryza sativa L.) and wheat ( Triticum aestivum L.) cultivars, while pimt , another valuable marker for seed longevity, may be deployed to enhance seed vigor in crops.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,959
Score d'incertitude au seuil0,782

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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