MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3097515415 · doi:10.1002/jms.4674

Identification of <scp><i>Sassafras albidum</i></scp> alkaloids by high‐performance thin‐layer chromatography tandem mass spectrometry and mapping by desorption electrospray ionization mass spectrometry imaging

2020· article· en· W3097515415 sur OpenAlexafffund
Rodrigo Souza Conceição, Consuelo J. Perez, Alexsandro Branco, Mariana Borges Botura, Demian R. Ifa

Notice bibliographique

RevueJournal of Mass Spectrometry · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensIONICS Mass Spectrometry (Canada)York University
Organismes subventionnairesFundação de Amparo à Pesquisa do Estado da BahiaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorYork University
Mots-clésChemistryMass spectrometryMass spectrometry imagingTandem mass spectrometryChromatographyElectrospray ionization

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Sassafras albidum is an important tree species that occurs across North America. The presence of benzylisoquinoline and aporphine alkaloids has been previously described; however, the spatial distribution of these compounds within S . albidum and other plants of Lauraceae family is still unclear. Mass spectrometry imaging has become an important tool in analysis of plants metabolites, uncovering important contributions about the functional role, biosynthetic pathway, and accumulation of these compounds in the plant. This work aimed to identify further alkaloids present in S . albidum roots, twigs, and leaves by high‐performance thin‐layer chromatography coupled to desorption electrospray ionization multistage mass spectrometry (HPTLC DESI‐MS n ) and to map the spatial distribution of these compounds by DESI‐MS imaging. A total of 12 alkaloids were indentified in the roots and twigs, and six of them were detected for the first time in S . albidum . A high number of alkaloids was found in S . albidum roots; however, alkaloids were not detected in the leaves. Cross sections of roots and twigs were blotted onto TLC plates assisted by heating and solvent extraction, and these imprints were analyzed by DESI‐MS imaging. The profile of alkaloid spatial distribution in DESI‐MS images showed different accumulation patterns across and within different plant parts. Most alkaloids displayed higher intensities in the outer‐most layer of the roots and twigs. The detailed spatial localization pattern of these alkaloids analyzed by DESI‐MS imaging in different plant parts could contribute to a better understanding of the profile of distribution, accumulation, and biosynthesis of benzylisoquinoline and aporphine alkaloids.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,238
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,005
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Mass SpectrometryMême sujetMass Spectrometry Techniques and ApplicationsTravaux en français237 207