MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3097593597 · doi:10.1182/blood-2020-140651

Plasmablastic Lymphoma: Synergism between<i>Wnt/B-Catenin</i>and the<i>RAS S</i>ignalling Molecules May Identify Potential Targets for Therapy

2020· article· en· W3097593597 sur OpenAlexaff
Hamza Kamran, Ariz Akhter, Hassan Rizwan, Meer-Taher Shahbani-Rad, Ghaleb Elyamany, Douglas A. Stewart, Adnan Mansoor

Notice bibliographique

RevueBlood · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésWnt signaling pathwayCancer researchLymphomaDiffuse large B-cell lymphomaBiologyCateninCarcinogenesisB-cell lymphomaCancerGeneImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background:Plasmablastic lymphoma (PBL), is a rare aggressive B-cell lymphoma that shares many overlapping characteristics with activated B-cell type diffuse large B-cell lymphoma (ABC-DLBCL) and multiple myeloma (MM). High expression ofWnt/β-cateninpathway molecules has been linked with several aspects of tumour biology in ABC-DLBCL and MM. In MMWnt/β-cateninplay critical role in chemoresistance, while high FOXP1 in ABC-DLBCL exert poor prognosis through up-regulation of theWnt/β-cateninsignalling pathway. There is strong evidence that enhanced crosstalk between the Wnt/β-catenin andRASpathways impact tumorigenesis and metastasis of cancerous stem cells in various cancers. In breast cancer; targeting theWnt/β-cateninand RAS pathways with small molecular inhibitors have shown effective results. The role of the Wnt/β-catenin signalling pathway and its corresponding linkage toRASsignalling molecules remained unknown in PBL. This pilot study provides preliminary data in relation to expressionof Wnt/β-cateninandRASpathways molecules in PBL in contrast to ABC-DLBCL. Method:FFPE RNA from diagnostic tissue samples in PBL patients (n=31) were compared with ABC-DLBCLs (n=18) patients for keyWnt/β-cateninandRASpathway molecules expression, utilizing nCounter (NanoString Technologies) platform. Qlucore Omics Explorer software was employed with defined criteria (fold change >2.0; p<0.01 and q <0.05) for statistical analysis. Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) from 5 publicly available gene data sets was used to analyze the expression of other accompanying pathways. Result:We identified significant differential expression of mRNA related toWnt/β-cateninsignalling between ABC-DLBCL and PBL (Figure 1). Expression ofWnt/β-cateninsignalling inhibitors (CXXC4, SFRP2, and DKK1) were significantly higher among PBL compared to ABC-DLBCL (8.12-3.22 log fold difference). In divergence, molecules linked withWnt/β-cateninsignalling activation were elevated in PBL when compared to ABC-DLBCL (FZD3andWNT10B). The GESA analysis proved that the RAS pathway was significantly up-regulated in PBL patients compared to ABC-DLBCL. In particular, the expression of crucial RAS pathway genes such asNRAS, RAF1, SHC1, andSOS1was significantly up-regulated in PBL patients when compared to ABC-DLBCL patients (Figure 2). Conclusion:Our data suggest that the expression ofWnt/B-catenintarget genes and ligands are enhanced in PBL patients along with the up-regulation of theRASsignalling pathway molecules as compared to ABC-DLBCL. The heightened expression of crucialWnt/B-catenininhibitors does not down-regulate the Wnt/β-catenin signalling. We anticipate that the combined down-regulation of theWnt/ β-cateninandRASpathways by targeting its key members (RAF1, NRAS, FZD3) may serve to contain tumor progression in PBL, hence impacting prognosis. Disclosures Stewart: Gilead:Honoraria;Sandoz:Honoraria;Teva:Honoraria;Amgen:Honoraria;Celgene:Honoraria;Abbvie:Honoraria;Roche:Honoraria;Janssen:Honoraria;Novartis:Honoraria;AstraZeneca:Honoraria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBlood→Même sujetUbiquitin and proteasome pathways→Travaux en français237 207→