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Enregistrement W3098199113 · doi:10.1038/s41467-020-19572-5

Germline AGO2 mutations impair RNA interference and human neurological development

2020· article· en· W3098199113 sur OpenAlexafffund
Davor Lessel, Daniela M. Zeitler, Margot R.F. Reijnders, Andriy Kazantsev, Fatemeh Hassani Nia, Alexander Bartholomäus, Victoria Martens, Astrid Bruckmann, Veronika Graus, Allyn McConkie‐Rosell, Marie McDonald, Bernarda Lozić, Ee‐Shien Tan, Erica H. Gerkes, Jessika Johannsen, Jonas Denecke, Aida Telegrafi, Evelien Zonneveld‐Huijssoon, Henny H. Lemmink, Breana Cham, Tanja Kovačević, Linda Ramsdell, Kimberly Foss, Diana Le Duc, Diana Mitter, Steffen Syrbe, Andreas Merkenschlager, Margje Sinnema, Bianca Panis, Joanna Lazier, Matthew Osmond, Taila Hartley, Jérémie Mortreux, Tiffany Busa, Chantal Missirian, Pankaj Prasun, Sabine Lüttgen, Ilaria Mannucci, Ivana Lessel, Claudia Schob, Stefan Kindler, John Pappas, Rachel Rabin, Marjolein H. Willemsen, Thatjana Gardeitchik, Katharina Löhner, Patrick Rump, Kerith‐Rae Dias, Carey‐Anne Evans, P. Ian Andrews, Tony Roscioli, Han G. Brunner, Chieko Chijiwa, M. E. Suzanne Lewis, Rami Abou Jamra, David A. Dyment, Kym M. Boycott, Alexander P.A. Stegmann, Christian Kubisch, Ene‐Choo Tan, Ghayda Mirzaa, Kirsty McWalter, Tjitske Kleefstra, Rolph Pfundt, Zoya Ignatova, Gunter Meister, Hans‐Jürgen Kreienkamp

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity of OttawaUniversity of British ColumbiaChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Health and Medical Research CouncilMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchUniversität LeipzigGenome AlbertaAgence Nationale de la RechercheWerner Otto StiftungNational Research Foundation SingaporeDeutsche ForschungsgemeinschaftNational Medical Research CouncilNational Research FoundationOntario Genomics InstituteGenome British ColumbiaDeutscher Akademischer AustauschdienstGenome CanadaOntario Genomics
Mots-clésArgonauteGene silencingRNA interferenceRNA-induced silencing complexBiologyRNARNA silencingmicroRNATranscriptomeMutationCell biologyGeneticsGene expressionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ARGONAUTE-2 and associated miRNAs form the RNA-induced silencing complex (RISC), which targets mRNAs for translational silencing and degradation as part of the RNA interference pathway. Despite the essential nature of this process for cellular function, there is little information on the role of RISC components in human development and organ function. We identify 13 heterozygous mutations in AGO2 in 21 patients affected by disturbances in neurological development. Each of the identified single amino acid mutations result in impaired shRNA-mediated silencing. We observe either impaired RISC formation or increased binding of AGO2 to mRNA targets as mutation specific functional consequences. The latter is supported by decreased phosphorylation of a C-terminal serine cluster involved in mRNA target release, increased formation of dendritic P-bodies in neurons and global transcriptome alterations in patient-derived primary fibroblasts. Our data emphasize the importance of gene expression regulation through the dynamic AGO2-RNA association for human neuronal development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,887
Score d'incertitude au seuil0,273

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations102
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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