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Enregistrement W3098926938 · doi:10.1101/813998

The pheromone and pheromone receptor mating-type locus is involved in controlling uniparental mitochondrial inheritance in <i>Cryptococcus</i>

2019· preprint· en· W3098926938 sur OpenAlexfundno aff
Sheng Sun, Ci Fu, Giuseppe Ianiri, Joseph Heitman

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Infections and Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthCanadian Institute for Advanced Research
Mots-clésBiologyMating typeLocus (genetics)Cryptococcus neoformansGeneticsMendelian inheritanceAllelePodospora anserinaPheromoneGeneNon-Mendelian inheritanceMitochondrial DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Mitochondria are inherited uniparentally during sexual reproduction in the majority of eukaryotic species studied, including humans, mice, nematodes, as well as many fungal species. Mitochondrial uniparental inheritance (mito-UPI) could be beneficial in that it avoids possible genetic conflicts between organelles with different genetic backgrounds, as recently shown in mice; and it could prevent the spread of selfish genetic elements in the mitochondrial genome. Despite the prevalence of observed mito-UPI, the underlying mechanisms and the genes involved in controlling this non-mendelian inheritance are poorly understood in many species. In Cryptococcus neoformans , a human pathogenic basidiomyceteous fungus, mating types ( MAT α and MAT a ) are defined by alternate alleles at the single MAT locus that evolved from fusion of the two MAT loci ( P/R encoding pheromones and pheromone receptors, HD encoding homeodomain transcription factors) that are the ancestral state in the basidiomycota. Mitochondria are inherited uniparentally from the MAT a parent in C. neoformans and this requires the SXI1 α and SXI2 a HD factors encoded by MAT . However, there is evidence additional genes contribute to control of mito-UPI in Cryptococcus . Here we show that in Cryptococcus amylolentus , a sibling species of C. neoformans with unlinked P/R and HD MAT loci, mitochondrial uniparental inheritance is controlled by the P/R locus, and is independent of the HD locus. Consistently, by replacing the MAT α alleles of the pheromones ( MF ) and pheromone receptor ( STE3 ) with the MAT a alleles, we show that these P/R locus defining genes indeed affect mito-UPI in C. neoformans during sexual reproduction. Additionally, we show that during early stages of C. neoformans sexual reproduction, conjugation tubes are always produced by the MAT α cells, resulting in unidirectional migration of the MAT α nucleus into the MAT a cell during zygote formation. This process is controlled by the P/R locus and could serve to physically restrict movement of MAT α mitochondria in the zygotes, and thereby contribute to mito-UPI. We propose a model in which both physical and genetic mechanisms function in concert to prevent the coexistence of mitochondria from the two parents in the zygote and subsequently in the meiotic progeny, thus ensuring mito-UPI in pathogenic Cryptococcus , as well as in closely related non-pathogenic species. The implications of these findings are discussed in the context of the evolution of mito-UPI in fungi and other more diverse eukaryotes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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