MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3099029676 · doi:10.1088/1741-2552/abc8d6

Predicting PTSD severity using longitudinal magnetoencephalography with a multi-step learning framework

2020· article· en· W3099029676 sur OpenAlexafffund
Jing Zhang, Simeon M. Wong, J. Don Richardson, Rakesh Jetly, Benjamin T. Dunkley

Notice bibliographique

RevueJournal of Neural Engineering · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoCanadian Armed ForcesSt Joseph's Health CareMental Health Research CanadaHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesCanadian Institute for Military and Veteran Health ResearchDefence Research and Development Canada
Mots-clésMagnetoencephalographyRandom forestFeature selectionSupport vector machineComputer scienceArtificial intelligenceFeature (linguistics)Machine learningRegressionPattern recognition (psychology)PsychologyStatisticsMathematicsNeuroscienceElectroencephalography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objective . The present study explores the effectiveness of incorporating temporal information in predicting post-traumatic stress disorder (PTSD) severity using magnetoencephalography (MEG) imaging data. The main objective was to assess the relationship between longitudinal MEG functional connectome data, measured across a variety of neural oscillatory frequencies and collected at two timepoints (Phase I and II), against PTSD severity captured at the later time point. Approach . We used an in-house developed informatics solution, featuring a two-step process featuring pre-learn feature selection (CV-SVR-rRF-FS, cross-validation with support vector regression (SVR) and recursive random forest feature selection) and deep learning (long-short term memory recurrent neural network, LSTM-RNN) techniques. Main results . The pre-learn step selected a small number of functional connections (or edges) from Phase I MEG data associated with Phase II PTSD severity, indexed using the PTSD CheckList (PCL) score. This strategy identified the functional edges affected by traumatic exposure and indexed disease severity, either permanently or evolving dynamically over time, for optimal predictive performance. Using the selected functional edges, LSTM modelling was used to incorporate the Phase II MEG data into longitudinal regression models. Single timepoint (Phase I and Phase II MEG data) SVR models were generated for comparison. Assessed with holdout test data, alpha and high gamma bands showed enhanced predictive performance with the longitudinal models comparing to the Phase I single timepoint models. The best predictive performance was observed for lower frequency ranges compared to the higher frequencies (low gamma), for both model types. Significance . This study identified the neural oscillatory signatures that benefited from additional temporal information when estimating the outcome of PTSD severity using MEG functional connectome data. Crucially, this approach can similarly be applied to any other mental health challenge, using this effective informatics foundation for longitudinal tracking of pathological brain states and predicting outcome with a MEG-based neurophysiology imaging system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,182
Score d'incertitude au seuil0,822

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Neural EngineeringMême sujetFunctional Brain Connectivity StudiesTravaux en français237 207