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Enregistrement W3099074835 · doi:10.1038/s41587-020-0700-3

Auto-deconvolution and molecular networking of gas chromatography–mass spectrometry data

2020· article· en· W3099074835 sur OpenAlexfundno aff
Alexander A. Aksenov, Ivan Laponogov, Zheng Zhang, Sophie Doran, Ilaria Belluomo, Dennis A. Veselkov, Wout Bittremieux, Louis‐Félix Nothias, Mélissa Nothias-Esposito, Katherine N. Maloney, Biswapriya B. Misra, Alexey V. Melnik, Aleksandr Smirnov, Xiuxia Du, Kenneth Lyons Jones, Kathleen Dorrestein, Morgan Panitchpakdi, Madeleine Ernst, Justin J. J. van der Hooft, Mabel González, Chiara Carazzone, Adolfo Amézquita, Chris Callewaert, James T. Morton, Robert A. Quinn, Amina Bouslimani, Andrea G. Albarracín Orio, Daniel Petras, Andrea M. Smania, Sneha Couvillion, Meagan Burnet, Carrie Nicora, Erika Zink, Thomas Metz, Viatcheslav B. Artaev, Elizabeth M. Humston-Fulmer, Rachel Gregor, Michaël M. Meijler, Itzhak Mizrahi, Stav Eyal, Brooke Anderson, Rachel J. Dutton, Raphaël Lugan, Pauline Le Boulch, Yann Guitton, Stéphanie Prévost, Audrey Poirier, Gaud Dervilly, Bruno Le Bizec, Aaron Fait, Noga Sikron Persi, Chao Song, Kelem Gashu, Roxana Coras, Mónica Gumá, Julia Manasson, José U. Scher, Dinesh Kumar Barupal, Saleh Alseekh, Alisdair R. Fernie, Reza Mirnezami, Vasilis Vasiliou, Robin Schmid, Р. С. Борисов, Л. Н. Куликова, Rob Knight, Mingxun Wang, George B. Hanna, Pieter C. Dorrestein, Kirill Veselkov

Notice bibliographique

RevueNature Biotechnology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesPacific Northwest National LaboratoryBiological and Environmental ResearchNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Institute of General Medical SciencesNational Cancer InstituteNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismNIHR Imperial Biomedical Research CentreRosetrees TrustNational Institutes of HealthUniversiteit GentFonds Wetenschappelijk OnderzoekConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y TécnicasEuropean Regional Development FundRUDN UniversityU.S. Department of EnergyEuropean CommissionAzrieli FoundationNational Science FoundationImperial College LondonUS-UK Fulbright CommissionNational Institute on AgingNational Institute for Health and Care ResearchNetherlands eScience CenterDepartamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación (COLCIENCIAS)BattelleVlaamse regeringGordon and Betty Moore FoundationUniversity of California, San DiegoAlfred P. Sloan Foundation
Mots-clésDeconvolutionWorkflowMass spectrometryFragmentation (computing)Computer scienceMass spectrometry imagingGas chromatography–mass spectrometryChromatographyMatrix decompositionChemistryAnalytical Chemistry (journal)Data miningAlgorithmPhysicsDatabase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,111
Score d'incertitude au seuil0,752

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations162
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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