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Enregistrement W3099120457 · doi:10.1101/391292

A transformation of oxygen saturation (the saturation virtual shunt) to improve clinical prediction model calibration and interpretation

2018· preprint· en· W3099120457 sur OpenAlexafffund
Guohai Zhou, Walter Karlen, Rollin Brant, Matthew O. Wiens, Niranjan Kissoon, J. Mark Ansermino

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSepsis Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesInternational Centre for Diarrhoeal Disease Research, BangladeshUniversity of British Columbia
Mots-clésSaturation (graph theory)Receiver operating characteristicMedicineLinearityStatisticsMathematicsPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Background The relationship between peripheral oxygen saturation (SpO 2 ) and the inspired oxygen concentration is non-linear. SpO 2 is frequently used as a dichotomized predictor, to manage this non-linearity. We propose the saturation virtual shunt (VS) as a transformation of SpO 2 to a continuous linear variable to improve interpretation of disease severity within clinical prediction models. Method We calculate the saturation VS based on an empirically derived approximation formula between physiological VS and SpO 2 . We evaluated the utility of the saturation VS in a clinical study predicting the need for facility admission in children in a low resource health-care setting. Results The transformation was saturation VS = 68.864*log 10 (103.711 − SpO 2 ) −52.110 . The ability to predict hospital admission based on a dichotomized SpO 2 produced an area under the receiver operating characteristic curve of 0.57, compared to 0.71 based on the untransformed SpO 2 and saturation VS . However, the untransformed SpO 2 demonstrated a lack of fit compared to the saturation VS (goodness-of-fit test p-value <0.0001 versus 0.098). The observed admission rates varied non-linearly with the untransformed SpO 2 but varied linearly with the saturation VS. Conclusion The saturation VS estimates a continuous linearly interpretable disease severity based on SpO 2 and improves clinical prediction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,031
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,033

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,031
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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