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Enregistrement W3099473307 · doi:10.1038/s41598-020-76939-w

Induction of TOC and TIC genes during photomorphogenesis is mediated primarily by cryptochrome 1 in Arabidopsis

2020· article· en· W3099473307 sur OpenAlexfundno aff
Hitoshi Fukazawa, Akari Tada, Lynn G.L. Richardson, Tomohiro Kakizaki, Susumu Uehara, Yasuko Ito‐Inaba, Takehito Inaba

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLight effects on plants
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaJapan Society for the Promotion of ScienceUniversity of Miyazaki
Mots-clésPhotomorphogenesisCryptochromeArabidopsisPlastidMutantBiologyPhotosynthesisCell biologyChloroplastGeneArabidopsis thalianaNuclear geneBotanyBiochemistryGenomeCircadian clock

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The majority of genes encoding photosynthesis-associated proteins in the nucleus are induced by light during photomorphogenesis, allowing plants to establish photoautotrophic growth. Therefore, optimizing the protein import apparatus of plastids, designated as the translocon at the outer and inner envelope membranes of chloroplast (TOC-TIC) complex, upon light exposure is a prerequisite to the import of abundant nuclear-encoded photosynthesis-associated proteins. However, the mechanism that coordinates the optimization of the TOC-TIC complex with the expression of nuclear-encoded photosynthesis-associated genes remains to be characterized in detail. To address this question, we investigated the mechanism by which plastid protein import is regulated by light during photomorphogenesis in Arabidopsis. We found that the albino plastid protein import2 (ppi2) mutant lacking Toc159 protein import receptors have active photoreceptors, even though the mutant fails to induce the expression of photosynthesis-associated nuclear genes upon light illumination. In contrast, many TOC and TIC genes are rapidly induced by blue light in both WT and the ppi2 mutant. We uncovered that this regulation is mediated primarily by cryptochrome 1 (CRY1). Furthermore, deficiency of CRY1 resulted in the decrease of some TOC proteins in vivo. Our results suggest that CRY1 plays key roles in optimizing the content of the TOC-TIC apparatus to accommodate the import of abundant photosynthesis-associated proteins during photomorphogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,134
Score d'incertitude au seuil0,336

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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