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Enregistrement W3099722764 · doi:10.1186/s12916-020-01797-2

Breast cancer risk factors and their effects on survival: a Mendelian randomisation study

2020· article· en· W3099722764 sur OpenAlexfundno aff
Maria Escala-Garcia, Anna Morra, Sander Canisius, Jenny Chang‐Claude, Siddhartha Kar, Wei Zheng, Stig E. Bojesen, Doug Easton, Paul D.P. Pharoah, Marjanka K. Schmidt

Notice bibliographique

RevueBMC Medicine · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesOvarian Cancer Research FundFondation du cancer du sein du QuébecCanadian Institutes of Health ResearchKWF KankerbestrijdingGenome CanadaNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthCancer Research UKGovernment of CanadaEuropean CommissionBreast Cancer Research Foundation
Mots-clésMedicineBreast cancerOncologyCancerInternal medicineMendelian randomizationMendelian inheritanceBioinformaticsGenotypeGeneticsGenetic variantsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Observational studies have investigated the association of risk factors with breast cancer prognosis. However, the results have been conflicting and it has been challenging to establish causality due to potential residual confounding. Using a Mendelian randomisation (MR) approach, we aimed to examine the potential causal association between breast cancer-specific survival and nine established risk factors for breast cancer: alcohol consumption, body mass index, height, physical activity, mammographic density, age at menarche or menopause, smoking, and type 2 diabetes mellitus (T2DM). METHODS: We conducted a two-sample MR analysis on data from the Breast Cancer Association Consortium (BCAC) and risk factor summary estimates from the GWAS Catalog. The BCAC data included 86,627 female patients of European ancestry with 7054 breast cancer-specific deaths during 15 years of follow-up. Of these, 59,378 were estrogen receptor (ER)-positive and 13,692 were ER-negative breast cancer patients. For the significant association, we used sensitivity analyses and a multivariable MR model. All risk factor associations were also examined in a model adjusted by other prognostic factors. RESULTS: Increased genetic liability to T2DM was significantly associated with worse breast cancer-specific survival (hazard ratio [HR] = 1.10, 95% confidence interval [CI] = 1.03-1.17, P value [P] = 0.003). There were no significant associations after multiple testing correction for any of the risk factors in the ER-status subtypes. For the reported significant association with T2DM, the sensitivity analyses did not show evidence for violation of the MR assumptions nor that the association was due to increased BMI. The association remained significant when adjusting by other prognostic factors. CONCLUSIONS: This extensive MR analysis suggests that T2DM may be causally associated with worse breast cancer-specific survival and therefore that treating T2DM may improve prognosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,352

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations105
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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