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Enregistrement W3100049547 · doi:10.1038/s41598-020-76459-7

A fast and fully-automated deep-learning approach for accurate hemorrhage segmentation and volume quantification in non-contrast whole-head CT

2020· article· en· W3100049547 sur OpenAlexafffund
Ali Arab, Betty Chinda, George Medvedev, William Siu, Hui Guo, Tao Gu, Sylvain Moreno, Ghassan Hamarneh, Martin Ester, Xiaowei Song

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Ischemic Stroke Management
Établissements canadiensFraser HealthRoyal Columbian HospitalSurrey Memorial HospitalSimon Fraser University
Organismes subventionnairesSurrey Hospitals FoundationSFU Community Trust Endowment FundTianjin Medical UniversitySimon Fraser University
Mots-clésConvolutional neural networkComputer scienceArtificial intelligenceVoxelSegmentationDeep learningSørensen–Dice coefficientPattern recognition (psychology)Contrast (vision)KappaProjection (relational algebra)Nuclear medicineMedicineImage segmentationMathematicsAlgorithm

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This project aimed to develop and evaluate a fast and fully-automated deep-learning method applying convolutional neural networks with deep supervision (CNN-DS) for accurate hematoma segmentation and volume quantification in computed tomography (CT) scans. Non-contrast whole-head CT scans of 55 patients with hemorrhagic stroke were used. Individual scans were standardized to 64 axial slices of 128 × 128 voxels. Each voxel was annotated independently by experienced raters, generating a binary label of hematoma versus normal brain tissue based on majority voting. The dataset was split randomly into training (n = 45) and testing (n = 10) subsets. A CNN-DS model was built applying the training data and examined using the testing data. Performance of the CNN-DS solution was compared with three previously established methods. The CNN-DS achieved a Dice coefficient score of 0.84 ± 0.06 and recall of 0.83 ± 0.07, higher than patch-wise U-Net (< 0.76). CNN-DS average running time of 0.74 ± 0.07 s was faster than PItcHPERFeCT (> 1412 s) and slice-based U-Net (> 12 s). Comparable interrater agreement rates were observed between "method-human" vs. "human-human" (Cohen's kappa coefficients > 0.82). The fully automated CNN-DS approach demonstrated expert-level accuracy in fast segmentation and quantification of hematoma, substantially improving over previous methods. Further research is warranted to test the CNN-DS solution as a software tool in clinical settings for effective stroke management.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,957
Score d'incertitude au seuil0,661

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations78
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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