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Enregistrement W3100402026 · doi:10.1101/034207

Genome-wide association study of offspring birth weight in 86,577 women highlights maternal genetic effects that are independent of fetal genetics

2015· preprint· en· W3100402026 sur OpenAlexaff
Robin N. Beaumont, Nicole M. Warrington, Alana Cavadino, Jessica Tyrrell, Michael Nodzenski, Momoko Horikoshi, Frank Geller, Ronny Myhre, Rebecca C. Richmond, Lavinia Paternoster, Jonathan P. Bradfield, Eskil Kreiner‐Møller, Ville Huikari, Sarah Metrustry, Kathryn L. Lunetta, Jodie N. Painter, Jouke‐Jan Hottenga, Catherine Allard, Sheila J. Barton, Ana Espinosa, Julie Marsh, Catherine Potter, Ge Zhang, Wei Ang, Diane J. Berry, Luigi Bouchard, Shikta Das, Håkon Håkonarson, Jani Heikkinen, Øyvind Helgeland, Berthold Hocher, Albert Hofman, Hazel Inskip, Samuel E. Jones, Manolis Kogevinas, Penelope A. Lind, Letizia Marullo, Sarah E. Medland, Anna Murray, Jeffrey C. Murray, Pål R. Njølstad, Ellen A. Nøhr, Christoph Reichetzeder, Susan M. Ring, Katherine S. Ruth, Loreto Santa‐Marina, Denise Scholtens, Sylvain Sebért, Verena Sengpiel, Marcus A. Tuke, Marc Vaudel, Michael N. Weedon, Gonneke Willemsen, Andrew R. Wood, Hanieh Yaghootkar, Louis J. Muglia, Meike Bartels, Caroline L. Relton, Craig E. Pennell, Leda Chatzi, Xavier Estivill, John W. Holloway, Dorret I. Boomsma, Grant W. Montgomery, Joanne M. Murabito, Tim D. Spector, Christine Power, Marjo‐Riitta Järvelin, Hans Bisgaard, Struan F.A. Grant, Thorkild I. A. Sørensen, Vincent W. V. Jaddoe, Bo Jacobsson, Mads Melbye, Mark I. McCarthy, Andrew T. Hattersley, M. Geoffrey Hayes, Timothy M. Frayling, Marie‐France Hivert, Janine F. Felix, Elina Hyppönen, William L. Lowe, David M. Evans, Debbie A. Lawlor, Bjarke Feenstra, Rachel M. Freathy

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2015
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBirth, Development, and Health
Établissements canadiensCégep de ChicoutimiUniversité de SherbrookeCentre Hospitalier Universitaire de Sherbrooke
Organismes subventionnairesEuropean Social FundEuropean Regional Development FundMedical Research CouncilNational Health and Medical Research CouncilEuropean CommissionHelse VestUniversitetet i BergenDiabetes Research and Wellness FoundationNational Institute for Health and Care ResearchFP7 Ideas: European Research CouncilWellcome Trust
Mots-clésGenome-wide association studyOffspringBiologyBirth weightFetusGenetic associationSingle-nucleotide polymorphismMaternal effectPregnancyGeneticsPhysiologyGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Genome-wide association studies (GWAS) of birth weight have focused on fetal genetics, while relatively little is known about how maternal genetic variation influences fetal growth. We aimed to identify maternal genetic variants associated with birth weight that could highlight potentially relevant maternal determinants of fetal growth. We meta-analysed GWAS data on up to 8.7 million SNPs in up to 86,577 women of European descent from the Early Growth Genetics (EGG) Consortium and the UK Biobank. We used structural equation modelling (SEM) and analyses of mother-child pairs to quantify the separate maternal and fetal genetic effects. Maternal SNPs at 10 loci ( MTNR1B, HMGA2, SH2B3, KCNAB1, L3MBTL3, GCK, EBF1, TCF7L2, ACTL9 and CYP3A7 ) showed evidence of association with offspring birth weight at P <5x10 -8 . The SEM analyses showed at least 7 of the 10 associations were consistent with effects of the maternal genotype acting via the intrauterine environment, rather than via effects of shared alleles with the fetus. Variants, or correlated proxies, at many of the loci had been previously associated with adult traits, including fasting glucose ( MTNR1B, GCK and TCF7L2 ) and sex hormone levels ( CYP3A7 ), and one ( EBF1 ) with gestational duration. The identified associations indicate effects of maternal glucose, cytochrome P450 activity and gestational duration, and potential effects of maternal blood pressure and immune function on fetal growth. Further characterization of these associations, for example in mechanistic and causal analyses, will enhance understanding of the potentially modifiable maternal determinants of fetal growth, with the goal of reducing the morbidity and mortality associated with low and high birth weights.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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