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Enregistrement W3100755365 · doi:10.1101/542985

A proposed microcosm for landscape ecology – beyond the binary to the patch-mosaic model

2019· preprint· en· W3100755365 sur OpenAlexaff
Yolanda F. Wiersma, Rachel D. Wigle, R. Troy McMullin

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLichen and fungal ecology
Établissements canadiensCanadian Museum of NatureMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEcologyLichenAbies balsameaMicrocosmYellow birchSampling (signal processing)Biological dispersalBiologyBalsamBotanyPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Microcosms such as pitcher plants, or patches of mosses on a rock surface, have been used worldwide to allow for manipulative experiments that test hypotheses for patterns observed at larger extents, such as dispersal or community assemblage. Such microcosms can also be applied to questions in landscape ecology, but are limited by their binary (patch/non-patch structure). Here we examine a more realistic model landscape system that shares the patch-mosaic structure common to kilometres-extent landscapes. This system of lichen thalli on tree trunks has been shown to have consistent spatial patterns across replicate microcosms, but only when sampling within a limited area. To be relevant for experimentation across scales, it is necessary to determine whether previously observed patterns are consistent when sampling across a broader region and when using different tree species. Here, we test for consistent landscape patch pattern in both maco- and micro-lichens across 21 balsam fir ( Abies balsamea ) and yellow birch ( Betula alleghaniensis ) trees. Methods We measured spatial pattern of lichen thalli along the trunks of two species of trees, at two spatial resolutions; trees within a single stand (∼100 × 50 m) and trees dispersed across a larger region (500 km 2 ). We used a “lichen ladder” comprised of 5 10 × 10 cm sampling blocks to quantify number of species and individuals in a 50 cm section of the tree trunk. We tested for similar patterns along the trunk and between the north and south sides at both sampling intensities using perMANOVA. Results We find that lichen patches on tree trunks can function as replicate microscoms for landscape ecology. Patterns of thalli along the trunks of trees and between the north and south aspects of the trunk are statistically significantly consistent, although there is variation between tree species, and groups of lichens included. Our microcosm could be used as a model system for landscape ecology research; but researchers should test for consistent patterns first.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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