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Enregistrement W3100936098 · doi:10.1101/2020.11.19.388678

Large-Scale Analysis of Circulating Amino Acids and Adipose Gene Expression in Relation to Abdominal Obesity

2020· preprint· en· W3100936098 sur OpenAlexaff
Maltais-Payette Ina, Vijay Jinchu, Marie-Michelle Simon, Jacques Corbeil, Francis Brière, Elin Grundberg, Tchernof André

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University and Génome Québec Innovation CentreUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAdipose tissueTranscriptomeObesityGlutamate receptorMedicineInternal medicineEndocrinologyCohortAbdominal obesityPhysiologyBioinformaticsBiologyGene expressionGeneMetabolic syndromeBiochemistryReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Background Circulating level of the amino acid glutamate is associated with central fat accumulation, yet the pathophysiology of this relationship remains unknown. We aimed to: i) refine and validate the association between circulating glutamate and abdominal obesity in a large population-based twin cohort; and ii) investigate whether transcriptomic profiles in adipose tissue could provide insight into biological mechanisms underlying the association. Methods First, in a cohort of 4,665 individuals from the TwinsUK resource, we identified individuals with abdominal obesity and compared prevalence of the latter across circulating glutamate quintiles. Second, we used transcriptomic signatures generated from adipose tissue, both subcutaneous and visceral, to investigate associations with circulating glutamate levels. Results Individuals in the top circulating glutamate quintile had a 7-fold higher prevalence of abdominal obesity compared to those in the bottom quintile. The adipose tissue transcriptomic analyses identified GLUL , encoding Glutamate-Ammonia Ligase, as being associated with circulating glutamate and abdominal obesity, with pronounced signatures in the visceral depot. Conclusion Circulating glutamate is positively associated with the prevalence of abdominal obesity which relates to dysregulated GLUL expression specifically in visceral adipose tissue.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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